Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LCA5Q86VQ0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LCA5Q86VQ0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LCA5Q86VQ0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LCA5Q86VQ0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LCA5Q86VQ0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LCA5Q86VQ0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LCA5Q86VQ0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LCA5Q86VQ0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LCA5Q86VQ0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LCA5Q86VQ0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LCA5Q86VQ0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LCA5Q86VQ0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LCA5Q86VQ0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LCA5Q86VQ0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LCA5Q86VQ0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LCA5Q86VQ0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LCA5Q86VQ0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LCA5Q86VQ0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LCA5Q86VQ0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LCA5Q86VQ0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LCA5Q86VQ0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LCA5Q86VQ0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LCA5Q86VQ0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LCA5Q86VQ0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LCA5Q86VQ0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LCA5Q86VQ0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LCA5Q86VQ0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LCA5Q86VQ0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LCA5Q86VQ0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LCA5Q86VQ0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LCA5Q86VQ0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LCA5Q86VQ0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LCA5Q86VQ0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LCA5Q86VQ0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LCA5Q86VQ0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LCA5Q86VQ0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LCA5Q86VQ0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LCA5Q86VQ0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LCA5Q86VQ0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LCA5Q86VQ0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LCA5Q86VQ0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LCA5Q86VQ0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LCA5Q86VQ0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LCA5Q86VQ0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LCA5Q86VQ0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LCA5Q86VQ0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LCA5Q86VQ0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LCA5Q86VQ0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LCA5Q86VQ0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LCA5Q86VQ0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LCA5Q86VQ0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LCA5Q86VQ0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LCA5Q86VQ0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LCA5Q86VQ0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LCA5Q86VQ0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LCA5Q86VQ0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LCA5Q86VQ0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LCA5Q86VQ0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LCA5Q86VQ0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LCA5Q86VQ0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LCA5Q86VQ0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LCA5Q86VQ0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LCA5Q86VQ0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LCA5Q86VQ0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LCA5Q86VQ0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LCA5Q86VQ0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LCA5Q86VQ0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LCA5Q86VQ0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LCA5Q86VQ0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LCA5Q86VQ0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LCA5Q86VQ0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LCA5Q86VQ0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LCA5Q86VQ0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LCA5Q86VQ0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LCA5Q86VQ0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LCA5Q86VQ0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LCA5Q86VQ0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LCA5Q86VQ0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LCA5Q86VQ0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LCA5Q86VQ0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LCA5Q86VQ0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LCA5Q86VQ0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LCA5Q86VQ0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LCA5Q86VQ0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LCA5Q86VQ0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LCA5Q86VQ0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LCA5Q86VQ0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LCA5Q86VQ0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LCA5Q86VQ0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LCA5Q86VQ0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LCA5Q86VQ0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LCA5Q86VQ0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LCA5Q86VQ0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LCA5Q86VQ0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LCA5Q86VQ0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LCA5Q86VQ0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LCA5Q86VQ0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LCA5Q86VQ0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LCA5Q86VQ0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms