Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD163Q86VB7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD163Q86VB7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD163Q86VB7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD163Q86VB7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD163Q86VB7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD163Q86VB7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD163Q86VB7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD163Q86VB7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD163Q86VB7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD163Q86VB7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD163Q86VB7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD163Q86VB7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD163Q86VB7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD163Q86VB7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD163Q86VB7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD163Q86VB7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD163Q86VB7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD163Q86VB7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD163Q86VB7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD163Q86VB7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD163Q86VB7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD163Q86VB7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD163Q86VB7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD163Q86VB7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD163Q86VB7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD163Q86VB7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD163Q86VB7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD163Q86VB7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD163Q86VB7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CD163Q86VB7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD163Q86VB7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD163Q86VB7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD163Q86VB7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD163Q86VB7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD163Q86VB7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CD163Q86VB7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD163Q86VB7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CD163Q86VB7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CD163Q86VB7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CD163Q86VB7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD163Q86VB7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CD163Q86VB7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CD163Q86VB7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CD163Q86VB7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD163Q86VB7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD163Q86VB7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD163Q86VB7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD163Q86VB7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CD163Q86VB7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD163Q86VB7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD163Q86VB7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD163Q86VB7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD163Q86VB7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD163Q86VB7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD163Q86VB7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD163Q86VB7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD163Q86VB7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CD163Q86VB7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD163Q86VB7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD163Q86VB7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD163Q86VB7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD163Q86VB7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD163Q86VB7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD163Q86VB7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD163Q86VB7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD163Q86VB7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD163Q86VB7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD163Q86VB7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD163Q86VB7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD163Q86VB7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD163Q86VB7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD163Q86VB7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD163Q86VB7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CD163Q86VB7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CD163Q86VB7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD163Q86VB7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD163Q86VB7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD163Q86VB7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD163Q86VB7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CD163Q86VB7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD163Q86VB7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD163Q86VB7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD163Q86VB7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD163Q86VB7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD163Q86VB7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD163Q86VB7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD163Q86VB7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD163Q86VB7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD163Q86VB7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD163Q86VB7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD163Q86VB7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD163Q86VB7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD163Q86VB7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD163Q86VB7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD163Q86VB7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD163Q86VB7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD163Q86VB7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD163Q86VB7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CD163Q86VB7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms