Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT5

PDZD3, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD3Q86UT5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDZD3Q86UT5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDZD3Q86UT5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDZD3Q86UT5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDZD3Q86UT5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDZD3Q86UT5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDZD3Q86UT5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PDZD3Q86UT5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PDZD3Q86UT5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDZD3Q86UT5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDZD3Q86UT5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDZD3Q86UT5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDZD3Q86UT5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDZD3Q86UT5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDZD3Q86UT5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDZD3Q86UT5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDZD3Q86UT5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDZD3Q86UT5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDZD3Q86UT5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDZD3Q86UT5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDZD3Q86UT5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDZD3Q86UT5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDZD3Q86UT5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDZD3Q86UT5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDZD3Q86UT5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZD3Q86UT5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZD3Q86UT5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZD3Q86UT5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZD3Q86UT5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZD3Q86UT5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZD3Q86UT5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDZD3Q86UT5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDZD3Q86UT5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDZD3Q86UT5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZD3Q86UT5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZD3Q86UT5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZD3Q86UT5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZD3Q86UT5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZD3Q86UT5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDZD3Q86UT5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDZD3Q86UT5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDZD3Q86UT5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDZD3Q86UT5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDZD3Q86UT5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDZD3Q86UT5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDZD3Q86UT5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PDZD3Q86UT5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDZD3Q86UT5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZD3Q86UT5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZD3Q86UT5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZD3Q86UT5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDZD3Q86UT5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDZD3Q86UT5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDZD3Q86UT5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZD3Q86UT5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZD3Q86UT5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZD3Q86UT5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZD3Q86UT5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZD3Q86UT5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZD3Q86UT5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZD3Q86UT5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZD3Q86UT5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZD3Q86UT5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZD3Q86UT5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZD3Q86UT5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZD3Q86UT5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDZD3Q86UT5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDZD3Q86UT5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZD3Q86UT5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZD3Q86UT5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZD3Q86UT5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZD3Q86UT5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZD3Q86UT5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZD3Q86UT5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZD3Q86UT5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZD3Q86UT5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZD3Q86UT5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZD3Q86UT5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZD3Q86UT5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZD3Q86UT5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZD3Q86UT5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZD3Q86UT5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZD3Q86UT5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZD3Q86UT5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZD3Q86UT5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZD3Q86UT5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZD3Q86UT5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZD3Q86UT5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZD3Q86UT5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDZD3Q86UT5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDZD3Q86UT5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZD3Q86UT5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZD3Q86UT5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZD3Q86UT5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZD3Q86UT5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZD3Q86UT5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZD3Q86UT5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZD3Q86UT5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZD3Q86UT5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZD3Q86UT5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms