Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
PBRM1Q86U86 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.44■■■■■ 4.7
PBRM1Q86U86 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
PBRM1Q86U86 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
PBRM1Q86U86 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.42■■■■■ 4.7
PBRM1Q86U86 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
PBRM1Q86U86 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
PBRM1Q86U86 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.39■■■■■ 4.7
PBRM1Q86U86 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC44.38■■■■■ 4.69
PBRM1Q86U86 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC44.36■■■■■ 4.69
PBRM1Q86U86 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
PBRM1Q86U86 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
PBRM1Q86U86 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC44.34■■■■■ 4.69
PBRM1Q86U86 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
PBRM1Q86U86 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.33■■■■■ 4.69
PBRM1Q86U86 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
PBRM1Q86U86 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
PBRM1Q86U86 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
PBRM1Q86U86 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
PBRM1Q86U86 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
PBRM1Q86U86 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
PBRM1Q86U86 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
PBRM1Q86U86 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
PBRM1Q86U86 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
PBRM1Q86U86 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.68
PBRM1Q86U86 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC44.32■■■■■ 4.68
PBRM1Q86U86 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
PBRM1Q86U86 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC44.28■■■■■ 4.68
PBRM1Q86U86 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
PBRM1Q86U86 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC44.26■■■■■ 4.68
PBRM1Q86U86 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
PBRM1Q86U86 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
PBRM1Q86U86 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
PBRM1Q86U86 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
PBRM1Q86U86 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
PBRM1Q86U86 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
PBRM1Q86U86 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC44.23■■■■■ 4.67
PBRM1Q86U86 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC44.23■■■■■ 4.67
PBRM1Q86U86 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
PBRM1Q86U86 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
PBRM1Q86U86 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC44.16■■■■■ 4.66
PBRM1Q86U86 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.16■■■■■ 4.66
PBRM1Q86U86 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC44.15■■■■■ 4.66
PBRM1Q86U86 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC44.15■■■■■ 4.66
PBRM1Q86U86 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
PBRM1Q86U86 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.66
PBRM1Q86U86 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.12■■■■■ 4.65
PBRM1Q86U86 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
PBRM1Q86U86 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC44.12■■■■■ 4.65
PBRM1Q86U86 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
PBRM1Q86U86 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC44.11■■■■■ 4.65
PBRM1Q86U86 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC44.1■■■■■ 4.65
PBRM1Q86U86 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
PBRM1Q86U86 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC44.09■■■■■ 4.65
PBRM1Q86U86 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
PBRM1Q86U86 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
PBRM1Q86U86 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.64
PBRM1Q86U86 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
PBRM1Q86U86 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
PBRM1Q86U86 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
PBRM1Q86U86 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.02■■■■■ 4.64
PBRM1Q86U86 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC44.01■■■■■ 4.64
PBRM1Q86U86 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC44.01■■■■■ 4.64
PBRM1Q86U86 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44■■■■■ 4.63
PBRM1Q86U86 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC44■■■■■ 4.63
PBRM1Q86U86 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44■■■■■ 4.63
PBRM1Q86U86 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC43.99■■■■■ 4.63
PBRM1Q86U86 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC43.98■■■■■ 4.63
PBRM1Q86U86 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.98■■■■■ 4.63
PBRM1Q86U86 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
PBRM1Q86U86 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
PBRM1Q86U86 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC43.95■■■■■ 4.63
PBRM1Q86U86 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC43.95■■■■■ 4.63
PBRM1Q86U86 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC43.95■■■■■ 4.63
PBRM1Q86U86 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC43.95■■■■■ 4.63
PBRM1Q86U86 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC43.94■■■■■ 4.63
PBRM1Q86U86 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC43.93■■■■■ 4.62
PBRM1Q86U86 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC43.91■■■■■ 4.62
PBRM1Q86U86 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC43.91■■■■■ 4.62
PBRM1Q86U86 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
PBRM1Q86U86 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC43.88■■■■■ 4.62
PBRM1Q86U86 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
PBRM1Q86U86 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC43.84■■■■■ 4.61
PBRM1Q86U86 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC43.84■■■■■ 4.61
PBRM1Q86U86 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
PBRM1Q86U86 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
PBRM1Q86U86 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.82■■■■■ 4.61
PBRM1Q86U86 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC43.81■■■■■ 4.6
PBRM1Q86U86 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.81■■■■■ 4.6
PBRM1Q86U86 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
PBRM1Q86U86 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
PBRM1Q86U86 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC43.79■■■■■ 4.6
PBRM1Q86U86 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
PBRM1Q86U86 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
PBRM1Q86U86 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
PBRM1Q86U86 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
PBRM1Q86U86 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.77■■■■■ 4.6
PBRM1Q86U86 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC43.77■■■■■ 4.6
PBRM1Q86U86 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC43.76■■■■■ 4.6
PBRM1Q86U86 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms