Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4I7

LIMS2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS2Q7Z4I7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
LIMS2Q7Z4I7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LIMS2Q7Z4I7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LIMS2Q7Z4I7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LIMS2Q7Z4I7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LIMS2Q7Z4I7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LIMS2Q7Z4I7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LIMS2Q7Z4I7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LIMS2Q7Z4I7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LIMS2Q7Z4I7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LIMS2Q7Z4I7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LIMS2Q7Z4I7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LIMS2Q7Z4I7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LIMS2Q7Z4I7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LIMS2Q7Z4I7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LIMS2Q7Z4I7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LIMS2Q7Z4I7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LIMS2Q7Z4I7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LIMS2Q7Z4I7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LIMS2Q7Z4I7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LIMS2Q7Z4I7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LIMS2Q7Z4I7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LIMS2Q7Z4I7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LIMS2Q7Z4I7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LIMS2Q7Z4I7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LIMS2Q7Z4I7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LIMS2Q7Z4I7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LIMS2Q7Z4I7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LIMS2Q7Z4I7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LIMS2Q7Z4I7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LIMS2Q7Z4I7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LIMS2Q7Z4I7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LIMS2Q7Z4I7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LIMS2Q7Z4I7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LIMS2Q7Z4I7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LIMS2Q7Z4I7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LIMS2Q7Z4I7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LIMS2Q7Z4I7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LIMS2Q7Z4I7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LIMS2Q7Z4I7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LIMS2Q7Z4I7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LIMS2Q7Z4I7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LIMS2Q7Z4I7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LIMS2Q7Z4I7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LIMS2Q7Z4I7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LIMS2Q7Z4I7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LIMS2Q7Z4I7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LIMS2Q7Z4I7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LIMS2Q7Z4I7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LIMS2Q7Z4I7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LIMS2Q7Z4I7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LIMS2Q7Z4I7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LIMS2Q7Z4I7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LIMS2Q7Z4I7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LIMS2Q7Z4I7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LIMS2Q7Z4I7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LIMS2Q7Z4I7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LIMS2Q7Z4I7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LIMS2Q7Z4I7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LIMS2Q7Z4I7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LIMS2Q7Z4I7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LIMS2Q7Z4I7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LIMS2Q7Z4I7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LIMS2Q7Z4I7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LIMS2Q7Z4I7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LIMS2Q7Z4I7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LIMS2Q7Z4I7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LIMS2Q7Z4I7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LIMS2Q7Z4I7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LIMS2Q7Z4I7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LIMS2Q7Z4I7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LIMS2Q7Z4I7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LIMS2Q7Z4I7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LIMS2Q7Z4I7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LIMS2Q7Z4I7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LIMS2Q7Z4I7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LIMS2Q7Z4I7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LIMS2Q7Z4I7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LIMS2Q7Z4I7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LIMS2Q7Z4I7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LIMS2Q7Z4I7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LIMS2Q7Z4I7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LIMS2Q7Z4I7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LIMS2Q7Z4I7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LIMS2Q7Z4I7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LIMS2Q7Z4I7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LIMS2Q7Z4I7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LIMS2Q7Z4I7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LIMS2Q7Z4I7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LIMS2Q7Z4I7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LIMS2Q7Z4I7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LIMS2Q7Z4I7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LIMS2Q7Z4I7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LIMS2Q7Z4I7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LIMS2Q7Z4I7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LIMS2Q7Z4I7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LIMS2Q7Z4I7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LIMS2Q7Z4I7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LIMS2Q7Z4I7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LIMS2Q7Z4I7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms