Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
OTOP2Q7RTS6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
OTOP2Q7RTS6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
OTOP2Q7RTS6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
OTOP2Q7RTS6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
OTOP2Q7RTS6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
OTOP2Q7RTS6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
OTOP2Q7RTS6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
OTOP2Q7RTS6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
OTOP2Q7RTS6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
OTOP2Q7RTS6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
OTOP2Q7RTS6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
OTOP2Q7RTS6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
OTOP2Q7RTS6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
OTOP2Q7RTS6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
OTOP2Q7RTS6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
OTOP2Q7RTS6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
OTOP2Q7RTS6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
OTOP2Q7RTS6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
OTOP2Q7RTS6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
OTOP2Q7RTS6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
OTOP2Q7RTS6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
OTOP2Q7RTS6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
OTOP2Q7RTS6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
OTOP2Q7RTS6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
OTOP2Q7RTS6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
OTOP2Q7RTS6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
OTOP2Q7RTS6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
OTOP2Q7RTS6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
OTOP2Q7RTS6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
OTOP2Q7RTS6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
OTOP2Q7RTS6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
OTOP2Q7RTS6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
OTOP2Q7RTS6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
OTOP2Q7RTS6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
OTOP2Q7RTS6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
OTOP2Q7RTS6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
OTOP2Q7RTS6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
OTOP2Q7RTS6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
OTOP2Q7RTS6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
OTOP2Q7RTS6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
OTOP2Q7RTS6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
OTOP2Q7RTS6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
OTOP2Q7RTS6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
OTOP2Q7RTS6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
OTOP2Q7RTS6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
OTOP2Q7RTS6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
OTOP2Q7RTS6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
OTOP2Q7RTS6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
OTOP2Q7RTS6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
OTOP2Q7RTS6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
OTOP2Q7RTS6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
OTOP2Q7RTS6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
OTOP2Q7RTS6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
OTOP2Q7RTS6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
OTOP2Q7RTS6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
OTOP2Q7RTS6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
OTOP2Q7RTS6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
OTOP2Q7RTS6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
OTOP2Q7RTS6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
OTOP2Q7RTS6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
OTOP2Q7RTS6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
OTOP2Q7RTS6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
OTOP2Q7RTS6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
OTOP2Q7RTS6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
OTOP2Q7RTS6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
OTOP2Q7RTS6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
OTOP2Q7RTS6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
OTOP2Q7RTS6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
OTOP2Q7RTS6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
OTOP2Q7RTS6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
OTOP2Q7RTS6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
OTOP2Q7RTS6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
OTOP2Q7RTS6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
OTOP2Q7RTS6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
OTOP2Q7RTS6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
OTOP2Q7RTS6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
OTOP2Q7RTS6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
OTOP2Q7RTS6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
OTOP2Q7RTS6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
OTOP2Q7RTS6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
OTOP2Q7RTS6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
OTOP2Q7RTS6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
OTOP2Q7RTS6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
OTOP2Q7RTS6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
OTOP2Q7RTS6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
OTOP2Q7RTS6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
OTOP2Q7RTS6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
OTOP2Q7RTS6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
OTOP2Q7RTS6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
OTOP2Q7RTS6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
OTOP2Q7RTS6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
OTOP2Q7RTS6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
OTOP2Q7RTS6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
OTOP2Q7RTS6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
OTOP2Q7RTS6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
OTOP2Q7RTS6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
OTOP2Q7RTS6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
OTOP2Q7RTS6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
OTOP2Q7RTS6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms