Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
OTOP3Q7RTS5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
OTOP3Q7RTS5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
OTOP3Q7RTS5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
OTOP3Q7RTS5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
OTOP3Q7RTS5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
OTOP3Q7RTS5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
OTOP3Q7RTS5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
OTOP3Q7RTS5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
OTOP3Q7RTS5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
OTOP3Q7RTS5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
OTOP3Q7RTS5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
OTOP3Q7RTS5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
OTOP3Q7RTS5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
OTOP3Q7RTS5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
OTOP3Q7RTS5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
OTOP3Q7RTS5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
OTOP3Q7RTS5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
OTOP3Q7RTS5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
OTOP3Q7RTS5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
OTOP3Q7RTS5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
OTOP3Q7RTS5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
OTOP3Q7RTS5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
OTOP3Q7RTS5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
OTOP3Q7RTS5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
OTOP3Q7RTS5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
OTOP3Q7RTS5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
OTOP3Q7RTS5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
OTOP3Q7RTS5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
OTOP3Q7RTS5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
OTOP3Q7RTS5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
OTOP3Q7RTS5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
OTOP3Q7RTS5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
OTOP3Q7RTS5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
OTOP3Q7RTS5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
OTOP3Q7RTS5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
OTOP3Q7RTS5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
OTOP3Q7RTS5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
OTOP3Q7RTS5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
OTOP3Q7RTS5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
OTOP3Q7RTS5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
OTOP3Q7RTS5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
OTOP3Q7RTS5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
OTOP3Q7RTS5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
OTOP3Q7RTS5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
OTOP3Q7RTS5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
OTOP3Q7RTS5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
OTOP3Q7RTS5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
OTOP3Q7RTS5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
OTOP3Q7RTS5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
OTOP3Q7RTS5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
OTOP3Q7RTS5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
OTOP3Q7RTS5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
OTOP3Q7RTS5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
OTOP3Q7RTS5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
OTOP3Q7RTS5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
OTOP3Q7RTS5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
OTOP3Q7RTS5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
OTOP3Q7RTS5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
OTOP3Q7RTS5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
OTOP3Q7RTS5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
OTOP3Q7RTS5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
OTOP3Q7RTS5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
OTOP3Q7RTS5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
OTOP3Q7RTS5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
OTOP3Q7RTS5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
OTOP3Q7RTS5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
OTOP3Q7RTS5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
OTOP3Q7RTS5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
OTOP3Q7RTS5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
OTOP3Q7RTS5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
OTOP3Q7RTS5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
OTOP3Q7RTS5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
OTOP3Q7RTS5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
OTOP3Q7RTS5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
OTOP3Q7RTS5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
OTOP3Q7RTS5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
OTOP3Q7RTS5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
OTOP3Q7RTS5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
OTOP3Q7RTS5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
OTOP3Q7RTS5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
OTOP3Q7RTS5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
OTOP3Q7RTS5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
OTOP3Q7RTS5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
OTOP3Q7RTS5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
OTOP3Q7RTS5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
OTOP3Q7RTS5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
OTOP3Q7RTS5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
OTOP3Q7RTS5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
OTOP3Q7RTS5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
OTOP3Q7RTS5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
OTOP3Q7RTS5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
OTOP3Q7RTS5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
OTOP3Q7RTS5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
OTOP3Q7RTS5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
OTOP3Q7RTS5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
OTOP3Q7RTS5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
OTOP3Q7RTS5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
OTOP3Q7RTS5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
OTOP3Q7RTS5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.2 ms