Protein–RNA interactions for Protein: Q7LBR1

CHMP1B, Charged multivesicular body protein 1b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1BQ7LBR1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP1BQ7LBR1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP1BQ7LBR1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP1BQ7LBR1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP1BQ7LBR1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP1BQ7LBR1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP1BQ7LBR1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP1BQ7LBR1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP1BQ7LBR1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP1BQ7LBR1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP1BQ7LBR1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP1BQ7LBR1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHMP1BQ7LBR1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHMP1BQ7LBR1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHMP1BQ7LBR1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP1BQ7LBR1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP1BQ7LBR1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP1BQ7LBR1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP1BQ7LBR1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP1BQ7LBR1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP1BQ7LBR1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP1BQ7LBR1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP1BQ7LBR1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP1BQ7LBR1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP1BQ7LBR1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP1BQ7LBR1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP1BQ7LBR1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP1BQ7LBR1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP1BQ7LBR1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP1BQ7LBR1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP1BQ7LBR1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP1BQ7LBR1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP1BQ7LBR1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP1BQ7LBR1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP1BQ7LBR1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP1BQ7LBR1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP1BQ7LBR1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP1BQ7LBR1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP1BQ7LBR1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP1BQ7LBR1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP1BQ7LBR1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP1BQ7LBR1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP1BQ7LBR1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP1BQ7LBR1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP1BQ7LBR1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP1BQ7LBR1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP1BQ7LBR1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP1BQ7LBR1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP1BQ7LBR1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP1BQ7LBR1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP1BQ7LBR1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP1BQ7LBR1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP1BQ7LBR1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP1BQ7LBR1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP1BQ7LBR1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP1BQ7LBR1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP1BQ7LBR1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP1BQ7LBR1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP1BQ7LBR1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP1BQ7LBR1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP1BQ7LBR1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP1BQ7LBR1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP1BQ7LBR1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP1BQ7LBR1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP1BQ7LBR1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP1BQ7LBR1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP1BQ7LBR1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP1BQ7LBR1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP1BQ7LBR1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP1BQ7LBR1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP1BQ7LBR1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP1BQ7LBR1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP1BQ7LBR1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP1BQ7LBR1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHMP1BQ7LBR1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHMP1BQ7LBR1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHMP1BQ7LBR1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHMP1BQ7LBR1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHMP1BQ7LBR1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP1BQ7LBR1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP1BQ7LBR1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP1BQ7LBR1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP1BQ7LBR1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP1BQ7LBR1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP1BQ7LBR1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP1BQ7LBR1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP1BQ7LBR1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP1BQ7LBR1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP1BQ7LBR1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP1BQ7LBR1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP1BQ7LBR1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP1BQ7LBR1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP1BQ7LBR1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP1BQ7LBR1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP1BQ7LBR1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP1BQ7LBR1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP1BQ7LBR1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP1BQ7LBR1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP1BQ7LBR1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP1BQ7LBR1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms