Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
RUFY3Q7L099 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
RUFY3Q7L099 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
RUFY3Q7L099 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
RUFY3Q7L099 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RUFY3Q7L099 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
RUFY3Q7L099 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RUFY3Q7L099 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
RUFY3Q7L099 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
RUFY3Q7L099 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RUFY3Q7L099 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RUFY3Q7L099 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RUFY3Q7L099 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RUFY3Q7L099 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
RUFY3Q7L099 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
RUFY3Q7L099 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RUFY3Q7L099 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RUFY3Q7L099 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RUFY3Q7L099 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RUFY3Q7L099 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RUFY3Q7L099 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RUFY3Q7L099 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RUFY3Q7L099 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RUFY3Q7L099 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RUFY3Q7L099 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RUFY3Q7L099 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
RUFY3Q7L099 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RUFY3Q7L099 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
RUFY3Q7L099 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
RUFY3Q7L099 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RUFY3Q7L099 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RUFY3Q7L099 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RUFY3Q7L099 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
RUFY3Q7L099 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RUFY3Q7L099 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RUFY3Q7L099 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RUFY3Q7L099 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
RUFY3Q7L099 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RUFY3Q7L099 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RUFY3Q7L099 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RUFY3Q7L099 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RUFY3Q7L099 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RUFY3Q7L099 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RUFY3Q7L099 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RUFY3Q7L099 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RUFY3Q7L099 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
RUFY3Q7L099 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RUFY3Q7L099 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RUFY3Q7L099 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RUFY3Q7L099 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RUFY3Q7L099 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RUFY3Q7L099 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RUFY3Q7L099 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RUFY3Q7L099 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RUFY3Q7L099 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RUFY3Q7L099 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
RUFY3Q7L099 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RUFY3Q7L099 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
RUFY3Q7L099 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
RUFY3Q7L099 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RUFY3Q7L099 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RUFY3Q7L099 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RUFY3Q7L099 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RUFY3Q7L099 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RUFY3Q7L099 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RUFY3Q7L099 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RUFY3Q7L099 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RUFY3Q7L099 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RUFY3Q7L099 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RUFY3Q7L099 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RUFY3Q7L099 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RUFY3Q7L099 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RUFY3Q7L099 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RUFY3Q7L099 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RUFY3Q7L099 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RUFY3Q7L099 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RUFY3Q7L099 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RUFY3Q7L099 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RUFY3Q7L099 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RUFY3Q7L099 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RUFY3Q7L099 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RUFY3Q7L099 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RUFY3Q7L099 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RUFY3Q7L099 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RUFY3Q7L099 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RUFY3Q7L099 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RUFY3Q7L099 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RUFY3Q7L099 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RUFY3Q7L099 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RUFY3Q7L099 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RUFY3Q7L099 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
RUFY3Q7L099 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RUFY3Q7L099 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RUFY3Q7L099 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RUFY3Q7L099 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RUFY3Q7L099 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RUFY3Q7L099 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RUFY3Q7L099 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RUFY3Q7L099 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RUFY3Q7L099 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms