Protein–RNA interactions for Protein: Q70JA7

CHSY3, Chondroitin sulfate synthase 3, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY3Q70JA7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHSY3Q70JA7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHSY3Q70JA7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHSY3Q70JA7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHSY3Q70JA7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHSY3Q70JA7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHSY3Q70JA7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHSY3Q70JA7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHSY3Q70JA7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHSY3Q70JA7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHSY3Q70JA7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHSY3Q70JA7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHSY3Q70JA7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHSY3Q70JA7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHSY3Q70JA7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CHSY3Q70JA7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHSY3Q70JA7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHSY3Q70JA7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHSY3Q70JA7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHSY3Q70JA7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHSY3Q70JA7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHSY3Q70JA7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHSY3Q70JA7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHSY3Q70JA7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHSY3Q70JA7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHSY3Q70JA7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHSY3Q70JA7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CHSY3Q70JA7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHSY3Q70JA7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHSY3Q70JA7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHSY3Q70JA7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHSY3Q70JA7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHSY3Q70JA7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHSY3Q70JA7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHSY3Q70JA7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHSY3Q70JA7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHSY3Q70JA7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHSY3Q70JA7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHSY3Q70JA7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHSY3Q70JA7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHSY3Q70JA7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHSY3Q70JA7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHSY3Q70JA7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHSY3Q70JA7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHSY3Q70JA7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHSY3Q70JA7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CHSY3Q70JA7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHSY3Q70JA7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHSY3Q70JA7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHSY3Q70JA7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHSY3Q70JA7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHSY3Q70JA7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHSY3Q70JA7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHSY3Q70JA7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHSY3Q70JA7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHSY3Q70JA7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHSY3Q70JA7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHSY3Q70JA7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHSY3Q70JA7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHSY3Q70JA7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHSY3Q70JA7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHSY3Q70JA7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHSY3Q70JA7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHSY3Q70JA7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHSY3Q70JA7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHSY3Q70JA7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHSY3Q70JA7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHSY3Q70JA7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHSY3Q70JA7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHSY3Q70JA7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHSY3Q70JA7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHSY3Q70JA7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHSY3Q70JA7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHSY3Q70JA7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHSY3Q70JA7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHSY3Q70JA7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHSY3Q70JA7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHSY3Q70JA7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHSY3Q70JA7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHSY3Q70JA7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHSY3Q70JA7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHSY3Q70JA7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHSY3Q70JA7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHSY3Q70JA7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHSY3Q70JA7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHSY3Q70JA7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHSY3Q70JA7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHSY3Q70JA7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHSY3Q70JA7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CHSY3Q70JA7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHSY3Q70JA7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHSY3Q70JA7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHSY3Q70JA7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHSY3Q70JA7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHSY3Q70JA7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHSY3Q70JA7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHSY3Q70JA7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHSY3Q70JA7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHSY3Q70JA7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHSY3Q70JA7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms