Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP43Q70EL4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP43Q70EL4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP43Q70EL4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP43Q70EL4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP43Q70EL4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP43Q70EL4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP43Q70EL4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP43Q70EL4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP43Q70EL4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP43Q70EL4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP43Q70EL4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP43Q70EL4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP43Q70EL4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP43Q70EL4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP43Q70EL4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP43Q70EL4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP43Q70EL4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP43Q70EL4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP43Q70EL4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP43Q70EL4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP43Q70EL4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP43Q70EL4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP43Q70EL4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP43Q70EL4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP43Q70EL4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP43Q70EL4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP43Q70EL4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP43Q70EL4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP43Q70EL4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP43Q70EL4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP43Q70EL4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP43Q70EL4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP43Q70EL4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP43Q70EL4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP43Q70EL4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP43Q70EL4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP43Q70EL4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP43Q70EL4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP43Q70EL4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP43Q70EL4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP43Q70EL4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP43Q70EL4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP43Q70EL4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP43Q70EL4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP43Q70EL4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP43Q70EL4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP43Q70EL4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP43Q70EL4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP43Q70EL4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP43Q70EL4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP43Q70EL4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP43Q70EL4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP43Q70EL4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP43Q70EL4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP43Q70EL4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP43Q70EL4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP43Q70EL4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP43Q70EL4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP43Q70EL4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP43Q70EL4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP43Q70EL4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP43Q70EL4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP43Q70EL4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP43Q70EL4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP43Q70EL4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP43Q70EL4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP43Q70EL4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP43Q70EL4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP43Q70EL4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP43Q70EL4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP43Q70EL4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP43Q70EL4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP43Q70EL4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP43Q70EL4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP43Q70EL4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP43Q70EL4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP43Q70EL4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP43Q70EL4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP43Q70EL4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP43Q70EL4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP43Q70EL4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP43Q70EL4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP43Q70EL4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP43Q70EL4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP43Q70EL4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP43Q70EL4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP43Q70EL4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP43Q70EL4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP43Q70EL4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP43Q70EL4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP43Q70EL4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP43Q70EL4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP43Q70EL4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP43Q70EL4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP43Q70EL4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP43Q70EL4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP43Q70EL4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP43Q70EL4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP43Q70EL4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms