Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL6

KIAA1549L, UPF0606 protein KIAA1549L, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549LQ6ZVL6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KIAA1549LQ6ZVL6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KIAA1549LQ6ZVL6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KIAA1549LQ6ZVL6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KIAA1549LQ6ZVL6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KIAA1549LQ6ZVL6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KIAA1549LQ6ZVL6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KIAA1549LQ6ZVL6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KIAA1549LQ6ZVL6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KIAA1549LQ6ZVL6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KIAA1549LQ6ZVL6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
KIAA1549LQ6ZVL6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIAA1549LQ6ZVL6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIAA1549LQ6ZVL6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIAA1549LQ6ZVL6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
KIAA1549LQ6ZVL6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIAA1549LQ6ZVL6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIAA1549LQ6ZVL6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIAA1549LQ6ZVL6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
KIAA1549LQ6ZVL6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
KIAA1549LQ6ZVL6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
KIAA1549LQ6ZVL6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KIAA1549LQ6ZVL6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KIAA1549LQ6ZVL6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KIAA1549LQ6ZVL6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
KIAA1549LQ6ZVL6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KIAA1549LQ6ZVL6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KIAA1549LQ6ZVL6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIAA1549LQ6ZVL6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIAA1549LQ6ZVL6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KIAA1549LQ6ZVL6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KIAA1549LQ6ZVL6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KIAA1549LQ6ZVL6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KIAA1549LQ6ZVL6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KIAA1549LQ6ZVL6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KIAA1549LQ6ZVL6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KIAA1549LQ6ZVL6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KIAA1549LQ6ZVL6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KIAA1549LQ6ZVL6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KIAA1549LQ6ZVL6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KIAA1549LQ6ZVL6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KIAA1549LQ6ZVL6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KIAA1549LQ6ZVL6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KIAA1549LQ6ZVL6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KIAA1549LQ6ZVL6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KIAA1549LQ6ZVL6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KIAA1549LQ6ZVL6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KIAA1549LQ6ZVL6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
KIAA1549LQ6ZVL6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KIAA1549LQ6ZVL6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KIAA1549LQ6ZVL6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KIAA1549LQ6ZVL6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
KIAA1549LQ6ZVL6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KIAA1549LQ6ZVL6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KIAA1549LQ6ZVL6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KIAA1549LQ6ZVL6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KIAA1549LQ6ZVL6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KIAA1549LQ6ZVL6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KIAA1549LQ6ZVL6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
KIAA1549LQ6ZVL6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIAA1549LQ6ZVL6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIAA1549LQ6ZVL6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIAA1549LQ6ZVL6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KIAA1549LQ6ZVL6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KIAA1549LQ6ZVL6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KIAA1549LQ6ZVL6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KIAA1549LQ6ZVL6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KIAA1549LQ6ZVL6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KIAA1549LQ6ZVL6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KIAA1549LQ6ZVL6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KIAA1549LQ6ZVL6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KIAA1549LQ6ZVL6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KIAA1549LQ6ZVL6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KIAA1549LQ6ZVL6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KIAA1549LQ6ZVL6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KIAA1549LQ6ZVL6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KIAA1549LQ6ZVL6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KIAA1549LQ6ZVL6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KIAA1549LQ6ZVL6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KIAA1549LQ6ZVL6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KIAA1549LQ6ZVL6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KIAA1549LQ6ZVL6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KIAA1549LQ6ZVL6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KIAA1549LQ6ZVL6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KIAA1549LQ6ZVL6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KIAA1549LQ6ZVL6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KIAA1549LQ6ZVL6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KIAA1549LQ6ZVL6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KIAA1549LQ6ZVL6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KIAA1549LQ6ZVL6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KIAA1549LQ6ZVL6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KIAA1549LQ6ZVL6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KIAA1549LQ6ZVL6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KIAA1549LQ6ZVL6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KIAA1549LQ6ZVL6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KIAA1549LQ6ZVL6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KIAA1549LQ6ZVL6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms