Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
FGD6Q6ZV73 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
FGD6Q6ZV73 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
FGD6Q6ZV73 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
FGD6Q6ZV73 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
FGD6Q6ZV73 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
FGD6Q6ZV73 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
FGD6Q6ZV73 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
FGD6Q6ZV73 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
FGD6Q6ZV73 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
FGD6Q6ZV73 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
FGD6Q6ZV73 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC40.4■■■■■ 4.06
FGD6Q6ZV73 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
FGD6Q6ZV73 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
FGD6Q6ZV73 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
FGD6Q6ZV73 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
FGD6Q6ZV73 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC40.39■■■■■ 4.06
FGD6Q6ZV73 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
FGD6Q6ZV73 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
FGD6Q6ZV73 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
FGD6Q6ZV73 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
FGD6Q6ZV73 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
FGD6Q6ZV73 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
FGD6Q6ZV73 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.04
FGD6Q6ZV73 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC40.3■■■■■ 4.04
FGD6Q6ZV73 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC40.3■■■■■ 4.04
FGD6Q6ZV73 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
FGD6Q6ZV73 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
FGD6Q6ZV73 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
FGD6Q6ZV73 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
FGD6Q6ZV73 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
FGD6Q6ZV73 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
FGD6Q6ZV73 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
FGD6Q6ZV73 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
FGD6Q6ZV73 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
FGD6Q6ZV73 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
FGD6Q6ZV73 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
FGD6Q6ZV73 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
FGD6Q6ZV73 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
FGD6Q6ZV73 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
FGD6Q6ZV73 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
FGD6Q6ZV73 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
FGD6Q6ZV73 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
FGD6Q6ZV73 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
FGD6Q6ZV73 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC40.18■■■■■ 4.02
FGD6Q6ZV73 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
FGD6Q6ZV73 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
FGD6Q6ZV73 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
FGD6Q6ZV73 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC40.16■■■■■ 4.02
FGD6Q6ZV73 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
FGD6Q6ZV73 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
FGD6Q6ZV73 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
FGD6Q6ZV73 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
FGD6Q6ZV73 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
FGD6Q6ZV73 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
FGD6Q6ZV73 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
FGD6Q6ZV73 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
FGD6Q6ZV73 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
FGD6Q6ZV73 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
FGD6Q6ZV73 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
FGD6Q6ZV73 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
FGD6Q6ZV73 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
FGD6Q6ZV73 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
FGD6Q6ZV73 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC40.08■■■■■ 4.01
FGD6Q6ZV73 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
FGD6Q6ZV73 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
FGD6Q6ZV73 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
FGD6Q6ZV73 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC40.06■■■■■ 4
FGD6Q6ZV73 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC40.06■■■■■ 4
FGD6Q6ZV73 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
FGD6Q6ZV73 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
FGD6Q6ZV73 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC40.03■■■■■ 4
FGD6Q6ZV73 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
FGD6Q6ZV73 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
FGD6Q6ZV73 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC40.03■■■■■ 4
FGD6Q6ZV73 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
FGD6Q6ZV73 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
FGD6Q6ZV73 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
FGD6Q6ZV73 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
FGD6Q6ZV73 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC40■■■■□ 3.99
FGD6Q6ZV73 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
FGD6Q6ZV73 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
FGD6Q6ZV73 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
FGD6Q6ZV73 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
FGD6Q6ZV73 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
FGD6Q6ZV73 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC39.99■■■■□ 3.99
FGD6Q6ZV73 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
FGD6Q6ZV73 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC39.98■■■■□ 3.99
FGD6Q6ZV73 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
FGD6Q6ZV73 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
FGD6Q6ZV73 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
FGD6Q6ZV73 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
FGD6Q6ZV73 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
FGD6Q6ZV73 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
FGD6Q6ZV73 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
FGD6Q6ZV73 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
FGD6Q6ZV73 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
FGD6Q6ZV73 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.98
FGD6Q6ZV73 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
FGD6Q6ZV73 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.7 ms