Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNI0

GCNT7, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 7, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT7Q6ZNI0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCNT7Q6ZNI0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCNT7Q6ZNI0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCNT7Q6ZNI0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GCNT7Q6ZNI0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCNT7Q6ZNI0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCNT7Q6ZNI0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GCNT7Q6ZNI0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GCNT7Q6ZNI0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GCNT7Q6ZNI0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GCNT7Q6ZNI0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GCNT7Q6ZNI0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GCNT7Q6ZNI0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GCNT7Q6ZNI0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCNT7Q6ZNI0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GCNT7Q6ZNI0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GCNT7Q6ZNI0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GCNT7Q6ZNI0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GCNT7Q6ZNI0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GCNT7Q6ZNI0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GCNT7Q6ZNI0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GCNT7Q6ZNI0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GCNT7Q6ZNI0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GCNT7Q6ZNI0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GCNT7Q6ZNI0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GCNT7Q6ZNI0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCNT7Q6ZNI0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCNT7Q6ZNI0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCNT7Q6ZNI0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCNT7Q6ZNI0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GCNT7Q6ZNI0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GCNT7Q6ZNI0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GCNT7Q6ZNI0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCNT7Q6ZNI0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCNT7Q6ZNI0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCNT7Q6ZNI0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCNT7Q6ZNI0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCNT7Q6ZNI0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCNT7Q6ZNI0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCNT7Q6ZNI0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GCNT7Q6ZNI0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GCNT7Q6ZNI0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GCNT7Q6ZNI0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GCNT7Q6ZNI0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GCNT7Q6ZNI0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GCNT7Q6ZNI0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GCNT7Q6ZNI0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GCNT7Q6ZNI0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GCNT7Q6ZNI0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GCNT7Q6ZNI0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCNT7Q6ZNI0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCNT7Q6ZNI0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCNT7Q6ZNI0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GCNT7Q6ZNI0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCNT7Q6ZNI0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCNT7Q6ZNI0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCNT7Q6ZNI0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCNT7Q6ZNI0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCNT7Q6ZNI0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCNT7Q6ZNI0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GCNT7Q6ZNI0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCNT7Q6ZNI0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCNT7Q6ZNI0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCNT7Q6ZNI0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCNT7Q6ZNI0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCNT7Q6ZNI0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GCNT7Q6ZNI0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GCNT7Q6ZNI0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GCNT7Q6ZNI0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCNT7Q6ZNI0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCNT7Q6ZNI0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCNT7Q6ZNI0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCNT7Q6ZNI0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCNT7Q6ZNI0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCNT7Q6ZNI0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GCNT7Q6ZNI0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GCNT7Q6ZNI0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCNT7Q6ZNI0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCNT7Q6ZNI0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCNT7Q6ZNI0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCNT7Q6ZNI0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCNT7Q6ZNI0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GCNT7Q6ZNI0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCNT7Q6ZNI0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCNT7Q6ZNI0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GCNT7Q6ZNI0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GCNT7Q6ZNI0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCNT7Q6ZNI0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCNT7Q6ZNI0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCNT7Q6ZNI0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCNT7Q6ZNI0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCNT7Q6ZNI0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCNT7Q6ZNI0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCNT7Q6ZNI0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCNT7Q6ZNI0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCNT7Q6ZNI0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCNT7Q6ZNI0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GCNT7Q6ZNI0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCNT7Q6ZNI0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCNT7Q6ZNI0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms