Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN30

BNC2, Zinc finger protein basonuclin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC2Q6ZN30 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BNC2Q6ZN30 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BNC2Q6ZN30 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BNC2Q6ZN30 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BNC2Q6ZN30 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BNC2Q6ZN30 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BNC2Q6ZN30 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BNC2Q6ZN30 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BNC2Q6ZN30 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BNC2Q6ZN30 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BNC2Q6ZN30 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BNC2Q6ZN30 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BNC2Q6ZN30 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BNC2Q6ZN30 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BNC2Q6ZN30 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BNC2Q6ZN30 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BNC2Q6ZN30 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BNC2Q6ZN30 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BNC2Q6ZN30 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BNC2Q6ZN30 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BNC2Q6ZN30 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BNC2Q6ZN30 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BNC2Q6ZN30 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BNC2Q6ZN30 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BNC2Q6ZN30 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BNC2Q6ZN30 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BNC2Q6ZN30 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BNC2Q6ZN30 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BNC2Q6ZN30 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BNC2Q6ZN30 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BNC2Q6ZN30 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BNC2Q6ZN30 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BNC2Q6ZN30 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BNC2Q6ZN30 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BNC2Q6ZN30 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BNC2Q6ZN30 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BNC2Q6ZN30 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BNC2Q6ZN30 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BNC2Q6ZN30 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BNC2Q6ZN30 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BNC2Q6ZN30 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BNC2Q6ZN30 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BNC2Q6ZN30 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BNC2Q6ZN30 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BNC2Q6ZN30 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BNC2Q6ZN30 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BNC2Q6ZN30 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BNC2Q6ZN30 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BNC2Q6ZN30 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BNC2Q6ZN30 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BNC2Q6ZN30 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BNC2Q6ZN30 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BNC2Q6ZN30 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BNC2Q6ZN30 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BNC2Q6ZN30 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BNC2Q6ZN30 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BNC2Q6ZN30 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BNC2Q6ZN30 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BNC2Q6ZN30 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BNC2Q6ZN30 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BNC2Q6ZN30 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BNC2Q6ZN30 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BNC2Q6ZN30 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BNC2Q6ZN30 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BNC2Q6ZN30 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BNC2Q6ZN30 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BNC2Q6ZN30 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BNC2Q6ZN30 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BNC2Q6ZN30 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BNC2Q6ZN30 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BNC2Q6ZN30 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BNC2Q6ZN30 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BNC2Q6ZN30 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BNC2Q6ZN30 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BNC2Q6ZN30 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BNC2Q6ZN30 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BNC2Q6ZN30 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BNC2Q6ZN30 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BNC2Q6ZN30 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BNC2Q6ZN30 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BNC2Q6ZN30 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BNC2Q6ZN30 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BNC2Q6ZN30 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BNC2Q6ZN30 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BNC2Q6ZN30 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BNC2Q6ZN30 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BNC2Q6ZN30 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BNC2Q6ZN30 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BNC2Q6ZN30 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BNC2Q6ZN30 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BNC2Q6ZN30 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BNC2Q6ZN30 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BNC2Q6ZN30 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BNC2Q6ZN30 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BNC2Q6ZN30 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BNC2Q6ZN30 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BNC2Q6ZN30 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BNC2Q6ZN30 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BNC2Q6ZN30 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BNC2Q6ZN30 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms