Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCNI2Q6ZMN8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCNI2Q6ZMN8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCNI2Q6ZMN8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCNI2Q6ZMN8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCNI2Q6ZMN8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCNI2Q6ZMN8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCNI2Q6ZMN8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCNI2Q6ZMN8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCNI2Q6ZMN8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCNI2Q6ZMN8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCNI2Q6ZMN8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCNI2Q6ZMN8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCNI2Q6ZMN8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCNI2Q6ZMN8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCNI2Q6ZMN8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCNI2Q6ZMN8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCNI2Q6ZMN8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCNI2Q6ZMN8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCNI2Q6ZMN8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCNI2Q6ZMN8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCNI2Q6ZMN8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCNI2Q6ZMN8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCNI2Q6ZMN8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCNI2Q6ZMN8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNI2Q6ZMN8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNI2Q6ZMN8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNI2Q6ZMN8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNI2Q6ZMN8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCNI2Q6ZMN8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCNI2Q6ZMN8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCNI2Q6ZMN8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCNI2Q6ZMN8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCNI2Q6ZMN8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCNI2Q6ZMN8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCNI2Q6ZMN8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCNI2Q6ZMN8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCNI2Q6ZMN8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCNI2Q6ZMN8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCNI2Q6ZMN8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCNI2Q6ZMN8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCNI2Q6ZMN8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCNI2Q6ZMN8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCNI2Q6ZMN8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCNI2Q6ZMN8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCNI2Q6ZMN8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCNI2Q6ZMN8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCNI2Q6ZMN8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CCNI2Q6ZMN8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCNI2Q6ZMN8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CCNI2Q6ZMN8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCNI2Q6ZMN8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCNI2Q6ZMN8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCNI2Q6ZMN8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCNI2Q6ZMN8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCNI2Q6ZMN8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCNI2Q6ZMN8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCNI2Q6ZMN8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNI2Q6ZMN8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNI2Q6ZMN8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCNI2Q6ZMN8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCNI2Q6ZMN8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCNI2Q6ZMN8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNI2Q6ZMN8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCNI2Q6ZMN8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCNI2Q6ZMN8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCNI2Q6ZMN8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCNI2Q6ZMN8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCNI2Q6ZMN8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCNI2Q6ZMN8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCNI2Q6ZMN8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCNI2Q6ZMN8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCNI2Q6ZMN8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCNI2Q6ZMN8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCNI2Q6ZMN8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCNI2Q6ZMN8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCNI2Q6ZMN8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCNI2Q6ZMN8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCNI2Q6ZMN8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCNI2Q6ZMN8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCNI2Q6ZMN8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCNI2Q6ZMN8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNI2Q6ZMN8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNI2Q6ZMN8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNI2Q6ZMN8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCNI2Q6ZMN8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCNI2Q6ZMN8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCNI2Q6ZMN8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCNI2Q6ZMN8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCNI2Q6ZMN8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCNI2Q6ZMN8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCNI2Q6ZMN8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNI2Q6ZMN8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNI2Q6ZMN8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNI2Q6ZMN8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNI2Q6ZMN8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNI2Q6ZMN8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNI2Q6ZMN8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCNI2Q6ZMN8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCNI2Q6ZMN8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms