Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPR3

RPTN, Repetin, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPTNQ6XPR3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPTNQ6XPR3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPTNQ6XPR3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPTNQ6XPR3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPTNQ6XPR3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPTNQ6XPR3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPTNQ6XPR3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPTNQ6XPR3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPTNQ6XPR3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPTNQ6XPR3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RPTNQ6XPR3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPTNQ6XPR3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPTNQ6XPR3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RPTNQ6XPR3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPTNQ6XPR3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPTNQ6XPR3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPTNQ6XPR3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPTNQ6XPR3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPTNQ6XPR3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPTNQ6XPR3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPTNQ6XPR3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPTNQ6XPR3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPTNQ6XPR3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPTNQ6XPR3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPTNQ6XPR3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPTNQ6XPR3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPTNQ6XPR3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPTNQ6XPR3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPTNQ6XPR3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPTNQ6XPR3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPTNQ6XPR3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPTNQ6XPR3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPTNQ6XPR3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPTNQ6XPR3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPTNQ6XPR3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPTNQ6XPR3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPTNQ6XPR3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPTNQ6XPR3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPTNQ6XPR3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPTNQ6XPR3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPTNQ6XPR3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPTNQ6XPR3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPTNQ6XPR3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RPTNQ6XPR3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPTNQ6XPR3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPTNQ6XPR3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPTNQ6XPR3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPTNQ6XPR3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RPTNQ6XPR3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPTNQ6XPR3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPTNQ6XPR3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPTNQ6XPR3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPTNQ6XPR3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPTNQ6XPR3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPTNQ6XPR3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPTNQ6XPR3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RPTNQ6XPR3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPTNQ6XPR3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPTNQ6XPR3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPTNQ6XPR3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPTNQ6XPR3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPTNQ6XPR3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPTNQ6XPR3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPTNQ6XPR3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPTNQ6XPR3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPTNQ6XPR3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPTNQ6XPR3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RPTNQ6XPR3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPTNQ6XPR3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPTNQ6XPR3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RPTNQ6XPR3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPTNQ6XPR3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPTNQ6XPR3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPTNQ6XPR3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPTNQ6XPR3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RPTNQ6XPR3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPTNQ6XPR3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPTNQ6XPR3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPTNQ6XPR3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPTNQ6XPR3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPTNQ6XPR3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPTNQ6XPR3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPTNQ6XPR3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPTNQ6XPR3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPTNQ6XPR3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPTNQ6XPR3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RPTNQ6XPR3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RPTNQ6XPR3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RPTNQ6XPR3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPTNQ6XPR3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPTNQ6XPR3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPTNQ6XPR3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPTNQ6XPR3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPTNQ6XPR3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPTNQ6XPR3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPTNQ6XPR3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPTNQ6XPR3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPTNQ6XPR3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPTNQ6XPR3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPTNQ6XPR3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms