Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMIGD1Q6UXZ0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMIGD1Q6UXZ0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMIGD1Q6UXZ0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMIGD1Q6UXZ0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMIGD1Q6UXZ0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMIGD1Q6UXZ0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMIGD1Q6UXZ0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMIGD1Q6UXZ0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMIGD1Q6UXZ0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMIGD1Q6UXZ0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMIGD1Q6UXZ0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMIGD1Q6UXZ0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMIGD1Q6UXZ0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMIGD1Q6UXZ0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMIGD1Q6UXZ0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMIGD1Q6UXZ0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMIGD1Q6UXZ0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMIGD1Q6UXZ0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMIGD1Q6UXZ0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TMIGD1Q6UXZ0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMIGD1Q6UXZ0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMIGD1Q6UXZ0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMIGD1Q6UXZ0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMIGD1Q6UXZ0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMIGD1Q6UXZ0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMIGD1Q6UXZ0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMIGD1Q6UXZ0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TMIGD1Q6UXZ0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMIGD1Q6UXZ0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMIGD1Q6UXZ0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMIGD1Q6UXZ0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMIGD1Q6UXZ0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TMIGD1Q6UXZ0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMIGD1Q6UXZ0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMIGD1Q6UXZ0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMIGD1Q6UXZ0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TMIGD1Q6UXZ0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMIGD1Q6UXZ0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMIGD1Q6UXZ0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMIGD1Q6UXZ0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMIGD1Q6UXZ0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMIGD1Q6UXZ0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMIGD1Q6UXZ0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMIGD1Q6UXZ0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMIGD1Q6UXZ0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMIGD1Q6UXZ0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMIGD1Q6UXZ0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMIGD1Q6UXZ0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMIGD1Q6UXZ0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMIGD1Q6UXZ0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMIGD1Q6UXZ0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMIGD1Q6UXZ0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMIGD1Q6UXZ0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMIGD1Q6UXZ0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMIGD1Q6UXZ0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMIGD1Q6UXZ0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMIGD1Q6UXZ0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMIGD1Q6UXZ0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMIGD1Q6UXZ0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMIGD1Q6UXZ0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMIGD1Q6UXZ0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMIGD1Q6UXZ0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMIGD1Q6UXZ0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMIGD1Q6UXZ0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TMIGD1Q6UXZ0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMIGD1Q6UXZ0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMIGD1Q6UXZ0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TMIGD1Q6UXZ0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMIGD1Q6UXZ0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMIGD1Q6UXZ0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMIGD1Q6UXZ0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMIGD1Q6UXZ0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMIGD1Q6UXZ0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMIGD1Q6UXZ0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMIGD1Q6UXZ0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMIGD1Q6UXZ0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMIGD1Q6UXZ0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMIGD1Q6UXZ0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMIGD1Q6UXZ0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMIGD1Q6UXZ0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMIGD1Q6UXZ0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMIGD1Q6UXZ0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMIGD1Q6UXZ0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMIGD1Q6UXZ0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMIGD1Q6UXZ0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMIGD1Q6UXZ0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMIGD1Q6UXZ0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMIGD1Q6UXZ0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMIGD1Q6UXZ0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMIGD1Q6UXZ0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMIGD1Q6UXZ0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMIGD1Q6UXZ0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TMIGD1Q6UXZ0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMIGD1Q6UXZ0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMIGD1Q6UXZ0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMIGD1Q6UXZ0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMIGD1Q6UXZ0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms