Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRIG3Q6UXM1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRIG3Q6UXM1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRIG3Q6UXM1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRIG3Q6UXM1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRIG3Q6UXM1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRIG3Q6UXM1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRIG3Q6UXM1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRIG3Q6UXM1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRIG3Q6UXM1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRIG3Q6UXM1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRIG3Q6UXM1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LRIG3Q6UXM1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LRIG3Q6UXM1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRIG3Q6UXM1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRIG3Q6UXM1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRIG3Q6UXM1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRIG3Q6UXM1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRIG3Q6UXM1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRIG3Q6UXM1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRIG3Q6UXM1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRIG3Q6UXM1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRIG3Q6UXM1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRIG3Q6UXM1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRIG3Q6UXM1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LRIG3Q6UXM1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRIG3Q6UXM1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRIG3Q6UXM1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRIG3Q6UXM1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRIG3Q6UXM1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRIG3Q6UXM1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRIG3Q6UXM1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRIG3Q6UXM1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRIG3Q6UXM1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRIG3Q6UXM1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRIG3Q6UXM1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRIG3Q6UXM1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRIG3Q6UXM1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
LRIG3Q6UXM1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRIG3Q6UXM1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRIG3Q6UXM1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRIG3Q6UXM1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRIG3Q6UXM1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRIG3Q6UXM1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRIG3Q6UXM1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRIG3Q6UXM1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRIG3Q6UXM1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRIG3Q6UXM1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRIG3Q6UXM1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRIG3Q6UXM1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRIG3Q6UXM1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRIG3Q6UXM1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRIG3Q6UXM1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRIG3Q6UXM1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRIG3Q6UXM1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRIG3Q6UXM1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRIG3Q6UXM1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRIG3Q6UXM1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRIG3Q6UXM1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRIG3Q6UXM1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRIG3Q6UXM1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRIG3Q6UXM1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRIG3Q6UXM1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRIG3Q6UXM1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LRIG3Q6UXM1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRIG3Q6UXM1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRIG3Q6UXM1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRIG3Q6UXM1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRIG3Q6UXM1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRIG3Q6UXM1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRIG3Q6UXM1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRIG3Q6UXM1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRIG3Q6UXM1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRIG3Q6UXM1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRIG3Q6UXM1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRIG3Q6UXM1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRIG3Q6UXM1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRIG3Q6UXM1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRIG3Q6UXM1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRIG3Q6UXM1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRIG3Q6UXM1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRIG3Q6UXM1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRIG3Q6UXM1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRIG3Q6UXM1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRIG3Q6UXM1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRIG3Q6UXM1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRIG3Q6UXM1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRIG3Q6UXM1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRIG3Q6UXM1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRIG3Q6UXM1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRIG3Q6UXM1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRIG3Q6UXM1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRIG3Q6UXM1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRIG3Q6UXM1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRIG3Q6UXM1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRIG3Q6UXM1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRIG3Q6UXM1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRIG3Q6UXM1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRIG3Q6UXM1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRIG3Q6UXM1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms