Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUSD1Q6UWL2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SUSD1Q6UWL2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SUSD1Q6UWL2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SUSD1Q6UWL2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SUSD1Q6UWL2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SUSD1Q6UWL2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SUSD1Q6UWL2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SUSD1Q6UWL2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUSD1Q6UWL2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUSD1Q6UWL2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUSD1Q6UWL2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUSD1Q6UWL2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUSD1Q6UWL2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SUSD1Q6UWL2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SUSD1Q6UWL2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SUSD1Q6UWL2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SUSD1Q6UWL2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SUSD1Q6UWL2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SUSD1Q6UWL2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SUSD1Q6UWL2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SUSD1Q6UWL2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SUSD1Q6UWL2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SUSD1Q6UWL2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SUSD1Q6UWL2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SUSD1Q6UWL2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SUSD1Q6UWL2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SUSD1Q6UWL2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SUSD1Q6UWL2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SUSD1Q6UWL2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SUSD1Q6UWL2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SUSD1Q6UWL2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SUSD1Q6UWL2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SUSD1Q6UWL2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SUSD1Q6UWL2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SUSD1Q6UWL2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUSD1Q6UWL2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUSD1Q6UWL2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUSD1Q6UWL2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUSD1Q6UWL2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUSD1Q6UWL2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SUSD1Q6UWL2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SUSD1Q6UWL2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SUSD1Q6UWL2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SUSD1Q6UWL2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SUSD1Q6UWL2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SUSD1Q6UWL2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SUSD1Q6UWL2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SUSD1Q6UWL2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SUSD1Q6UWL2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SUSD1Q6UWL2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SUSD1Q6UWL2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SUSD1Q6UWL2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SUSD1Q6UWL2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SUSD1Q6UWL2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD1Q6UWL2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD1Q6UWL2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD1Q6UWL2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD1Q6UWL2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD1Q6UWL2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD1Q6UWL2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SUSD1Q6UWL2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SUSD1Q6UWL2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SUSD1Q6UWL2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SUSD1Q6UWL2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SUSD1Q6UWL2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SUSD1Q6UWL2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SUSD1Q6UWL2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SUSD1Q6UWL2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SUSD1Q6UWL2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SUSD1Q6UWL2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SUSD1Q6UWL2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SUSD1Q6UWL2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SUSD1Q6UWL2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUSD1Q6UWL2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUSD1Q6UWL2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUSD1Q6UWL2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SUSD1Q6UWL2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SUSD1Q6UWL2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUSD1Q6UWL2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUSD1Q6UWL2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUSD1Q6UWL2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SUSD1Q6UWL2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SUSD1Q6UWL2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SUSD1Q6UWL2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SUSD1Q6UWL2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUSD1Q6UWL2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUSD1Q6UWL2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUSD1Q6UWL2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUSD1Q6UWL2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SUSD1Q6UWL2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD1Q6UWL2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD1Q6UWL2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD1Q6UWL2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD1Q6UWL2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD1Q6UWL2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD1Q6UWL2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD1Q6UWL2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUSD1Q6UWL2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SUSD1Q6UWL2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms