Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUI8

C19orf48, Uncharacterized protein C19orf48, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf48Q6RUI8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
C19orf48Q6RUI8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C19orf48Q6RUI8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C19orf48Q6RUI8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C19orf48Q6RUI8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C19orf48Q6RUI8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C19orf48Q6RUI8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C19orf48Q6RUI8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C19orf48Q6RUI8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C19orf48Q6RUI8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C19orf48Q6RUI8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C19orf48Q6RUI8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C19orf48Q6RUI8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C19orf48Q6RUI8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
C19orf48Q6RUI8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C19orf48Q6RUI8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C19orf48Q6RUI8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C19orf48Q6RUI8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C19orf48Q6RUI8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C19orf48Q6RUI8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C19orf48Q6RUI8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C19orf48Q6RUI8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C19orf48Q6RUI8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C19orf48Q6RUI8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C19orf48Q6RUI8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C19orf48Q6RUI8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C19orf48Q6RUI8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C19orf48Q6RUI8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C19orf48Q6RUI8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C19orf48Q6RUI8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C19orf48Q6RUI8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C19orf48Q6RUI8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C19orf48Q6RUI8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C19orf48Q6RUI8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C19orf48Q6RUI8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C19orf48Q6RUI8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C19orf48Q6RUI8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C19orf48Q6RUI8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C19orf48Q6RUI8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C19orf48Q6RUI8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C19orf48Q6RUI8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C19orf48Q6RUI8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C19orf48Q6RUI8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C19orf48Q6RUI8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C19orf48Q6RUI8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C19orf48Q6RUI8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C19orf48Q6RUI8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C19orf48Q6RUI8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C19orf48Q6RUI8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C19orf48Q6RUI8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C19orf48Q6RUI8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C19orf48Q6RUI8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C19orf48Q6RUI8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C19orf48Q6RUI8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
C19orf48Q6RUI8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C19orf48Q6RUI8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C19orf48Q6RUI8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C19orf48Q6RUI8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C19orf48Q6RUI8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C19orf48Q6RUI8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C19orf48Q6RUI8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
C19orf48Q6RUI8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C19orf48Q6RUI8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C19orf48Q6RUI8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C19orf48Q6RUI8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C19orf48Q6RUI8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C19orf48Q6RUI8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C19orf48Q6RUI8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C19orf48Q6RUI8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C19orf48Q6RUI8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C19orf48Q6RUI8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C19orf48Q6RUI8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C19orf48Q6RUI8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C19orf48Q6RUI8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C19orf48Q6RUI8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C19orf48Q6RUI8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C19orf48Q6RUI8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C19orf48Q6RUI8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C19orf48Q6RUI8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C19orf48Q6RUI8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C19orf48Q6RUI8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C19orf48Q6RUI8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C19orf48Q6RUI8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C19orf48Q6RUI8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C19orf48Q6RUI8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C19orf48Q6RUI8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C19orf48Q6RUI8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C19orf48Q6RUI8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
C19orf48Q6RUI8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C19orf48Q6RUI8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C19orf48Q6RUI8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C19orf48Q6RUI8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C19orf48Q6RUI8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C19orf48Q6RUI8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C19orf48Q6RUI8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C19orf48Q6RUI8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C19orf48Q6RUI8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C19orf48Q6RUI8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C19orf48Q6RUI8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C19orf48Q6RUI8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 802.6 ms