Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIW4

FIGNL1, Fidgetin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FIGNL1Q6PIW4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FIGNL1Q6PIW4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FIGNL1Q6PIW4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FIGNL1Q6PIW4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FIGNL1Q6PIW4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FIGNL1Q6PIW4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FIGNL1Q6PIW4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FIGNL1Q6PIW4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FIGNL1Q6PIW4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FIGNL1Q6PIW4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FIGNL1Q6PIW4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FIGNL1Q6PIW4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FIGNL1Q6PIW4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FIGNL1Q6PIW4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FIGNL1Q6PIW4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FIGNL1Q6PIW4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FIGNL1Q6PIW4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FIGNL1Q6PIW4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FIGNL1Q6PIW4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FIGNL1Q6PIW4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FIGNL1Q6PIW4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FIGNL1Q6PIW4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FIGNL1Q6PIW4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FIGNL1Q6PIW4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FIGNL1Q6PIW4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FIGNL1Q6PIW4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FIGNL1Q6PIW4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FIGNL1Q6PIW4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FIGNL1Q6PIW4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FIGNL1Q6PIW4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FIGNL1Q6PIW4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FIGNL1Q6PIW4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FIGNL1Q6PIW4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FIGNL1Q6PIW4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FIGNL1Q6PIW4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FIGNL1Q6PIW4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FIGNL1Q6PIW4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FIGNL1Q6PIW4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FIGNL1Q6PIW4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FIGNL1Q6PIW4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FIGNL1Q6PIW4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FIGNL1Q6PIW4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FIGNL1Q6PIW4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FIGNL1Q6PIW4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FIGNL1Q6PIW4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FIGNL1Q6PIW4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FIGNL1Q6PIW4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FIGNL1Q6PIW4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FIGNL1Q6PIW4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FIGNL1Q6PIW4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FIGNL1Q6PIW4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FIGNL1Q6PIW4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FIGNL1Q6PIW4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FIGNL1Q6PIW4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FIGNL1Q6PIW4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FIGNL1Q6PIW4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FIGNL1Q6PIW4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FIGNL1Q6PIW4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FIGNL1Q6PIW4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FIGNL1Q6PIW4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FIGNL1Q6PIW4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FIGNL1Q6PIW4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FIGNL1Q6PIW4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FIGNL1Q6PIW4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FIGNL1Q6PIW4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FIGNL1Q6PIW4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FIGNL1Q6PIW4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FIGNL1Q6PIW4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FIGNL1Q6PIW4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FIGNL1Q6PIW4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FIGNL1Q6PIW4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FIGNL1Q6PIW4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FIGNL1Q6PIW4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FIGNL1Q6PIW4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FIGNL1Q6PIW4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FIGNL1Q6PIW4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FIGNL1Q6PIW4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FIGNL1Q6PIW4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FIGNL1Q6PIW4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FIGNL1Q6PIW4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FIGNL1Q6PIW4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FIGNL1Q6PIW4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FIGNL1Q6PIW4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FIGNL1Q6PIW4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FIGNL1Q6PIW4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FIGNL1Q6PIW4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FIGNL1Q6PIW4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FIGNL1Q6PIW4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FIGNL1Q6PIW4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FIGNL1Q6PIW4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FIGNL1Q6PIW4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FIGNL1Q6PIW4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FIGNL1Q6PIW4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FIGNL1Q6PIW4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FIGNL1Q6PIW4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FIGNL1Q6PIW4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FIGNL1Q6PIW4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FIGNL1Q6PIW4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FIGNL1Q6PIW4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FIGNL1Q6PIW4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms