Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIF2

SYCE2, Synaptonemal complex central element protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE2Q6PIF2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SYCE2Q6PIF2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYCE2Q6PIF2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYCE2Q6PIF2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYCE2Q6PIF2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYCE2Q6PIF2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYCE2Q6PIF2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYCE2Q6PIF2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYCE2Q6PIF2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYCE2Q6PIF2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYCE2Q6PIF2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYCE2Q6PIF2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYCE2Q6PIF2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYCE2Q6PIF2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYCE2Q6PIF2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYCE2Q6PIF2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYCE2Q6PIF2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYCE2Q6PIF2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYCE2Q6PIF2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYCE2Q6PIF2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYCE2Q6PIF2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYCE2Q6PIF2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYCE2Q6PIF2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYCE2Q6PIF2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYCE2Q6PIF2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYCE2Q6PIF2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYCE2Q6PIF2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYCE2Q6PIF2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYCE2Q6PIF2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCE2Q6PIF2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYCE2Q6PIF2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYCE2Q6PIF2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYCE2Q6PIF2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYCE2Q6PIF2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYCE2Q6PIF2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYCE2Q6PIF2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SYCE2Q6PIF2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYCE2Q6PIF2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYCE2Q6PIF2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYCE2Q6PIF2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYCE2Q6PIF2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYCE2Q6PIF2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYCE2Q6PIF2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYCE2Q6PIF2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYCE2Q6PIF2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYCE2Q6PIF2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYCE2Q6PIF2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYCE2Q6PIF2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYCE2Q6PIF2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYCE2Q6PIF2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYCE2Q6PIF2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCE2Q6PIF2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCE2Q6PIF2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCE2Q6PIF2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCE2Q6PIF2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCE2Q6PIF2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCE2Q6PIF2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYCE2Q6PIF2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYCE2Q6PIF2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYCE2Q6PIF2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYCE2Q6PIF2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCE2Q6PIF2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCE2Q6PIF2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCE2Q6PIF2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCE2Q6PIF2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCE2Q6PIF2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCE2Q6PIF2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCE2Q6PIF2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCE2Q6PIF2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCE2Q6PIF2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SYCE2Q6PIF2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SYCE2Q6PIF2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYCE2Q6PIF2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCE2Q6PIF2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCE2Q6PIF2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCE2Q6PIF2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYCE2Q6PIF2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYCE2Q6PIF2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYCE2Q6PIF2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYCE2Q6PIF2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SYCE2Q6PIF2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYCE2Q6PIF2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCE2Q6PIF2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCE2Q6PIF2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCE2Q6PIF2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCE2Q6PIF2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCE2Q6PIF2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCE2Q6PIF2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYCE2Q6PIF2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYCE2Q6PIF2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYCE2Q6PIF2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCE2Q6PIF2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCE2Q6PIF2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCE2Q6PIF2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCE2Q6PIF2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYCE2Q6PIF2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYCE2Q6PIF2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYCE2Q6PIF2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYCE2Q6PIF2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYCE2Q6PIF2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms