Protein–RNA interactions for Protein: Q6P499

NIPAL3, NIPA-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL3Q6P499 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NIPAL3Q6P499 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NIPAL3Q6P499 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NIPAL3Q6P499 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NIPAL3Q6P499 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NIPAL3Q6P499 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NIPAL3Q6P499 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NIPAL3Q6P499 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NIPAL3Q6P499 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NIPAL3Q6P499 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NIPAL3Q6P499 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
NIPAL3Q6P499 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NIPAL3Q6P499 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NIPAL3Q6P499 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NIPAL3Q6P499 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NIPAL3Q6P499 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NIPAL3Q6P499 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NIPAL3Q6P499 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NIPAL3Q6P499 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NIPAL3Q6P499 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NIPAL3Q6P499 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NIPAL3Q6P499 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NIPAL3Q6P499 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NIPAL3Q6P499 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NIPAL3Q6P499 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NIPAL3Q6P499 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIPAL3Q6P499 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIPAL3Q6P499 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIPAL3Q6P499 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIPAL3Q6P499 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NIPAL3Q6P499 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NIPAL3Q6P499 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NIPAL3Q6P499 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIPAL3Q6P499 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIPAL3Q6P499 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIPAL3Q6P499 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIPAL3Q6P499 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIPAL3Q6P499 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIPAL3Q6P499 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NIPAL3Q6P499 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NIPAL3Q6P499 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NIPAL3Q6P499 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NIPAL3Q6P499 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NIPAL3Q6P499 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NIPAL3Q6P499 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIPAL3Q6P499 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIPAL3Q6P499 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NIPAL3Q6P499 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIPAL3Q6P499 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIPAL3Q6P499 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIPAL3Q6P499 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NIPAL3Q6P499 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NIPAL3Q6P499 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NIPAL3Q6P499 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIPAL3Q6P499 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIPAL3Q6P499 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIPAL3Q6P499 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIPAL3Q6P499 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIPAL3Q6P499 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIPAL3Q6P499 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NIPAL3Q6P499 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NIPAL3Q6P499 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NIPAL3Q6P499 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NIPAL3Q6P499 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NIPAL3Q6P499 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NIPAL3Q6P499 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIPAL3Q6P499 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIPAL3Q6P499 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIPAL3Q6P499 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NIPAL3Q6P499 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NIPAL3Q6P499 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NIPAL3Q6P499 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIPAL3Q6P499 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIPAL3Q6P499 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIPAL3Q6P499 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIPAL3Q6P499 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIPAL3Q6P499 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIPAL3Q6P499 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIPAL3Q6P499 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIPAL3Q6P499 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIPAL3Q6P499 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NIPAL3Q6P499 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NIPAL3Q6P499 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NIPAL3Q6P499 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIPAL3Q6P499 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIPAL3Q6P499 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIPAL3Q6P499 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIPAL3Q6P499 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIPAL3Q6P499 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIPAL3Q6P499 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIPAL3Q6P499 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIPAL3Q6P499 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIPAL3Q6P499 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIPAL3Q6P499 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIPAL3Q6P499 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NIPAL3Q6P499 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIPAL3Q6P499 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIPAL3Q6P499 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIPAL3Q6P499 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIPAL3Q6P499 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms