Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT4

SLC30A6, Zinc transporter 6, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC30A6Q6NXT4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC30A6Q6NXT4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC30A6Q6NXT4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC30A6Q6NXT4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC30A6Q6NXT4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC30A6Q6NXT4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC30A6Q6NXT4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC30A6Q6NXT4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC30A6Q6NXT4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC30A6Q6NXT4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC30A6Q6NXT4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC30A6Q6NXT4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC30A6Q6NXT4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC30A6Q6NXT4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC30A6Q6NXT4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC30A6Q6NXT4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC30A6Q6NXT4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC30A6Q6NXT4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC30A6Q6NXT4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC30A6Q6NXT4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC30A6Q6NXT4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC30A6Q6NXT4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC30A6Q6NXT4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC30A6Q6NXT4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC30A6Q6NXT4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC30A6Q6NXT4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC30A6Q6NXT4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC30A6Q6NXT4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC30A6Q6NXT4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC30A6Q6NXT4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC30A6Q6NXT4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC30A6Q6NXT4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC30A6Q6NXT4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC30A6Q6NXT4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC30A6Q6NXT4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC30A6Q6NXT4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC30A6Q6NXT4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC30A6Q6NXT4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC30A6Q6NXT4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC30A6Q6NXT4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC30A6Q6NXT4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC30A6Q6NXT4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC30A6Q6NXT4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC30A6Q6NXT4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC30A6Q6NXT4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC30A6Q6NXT4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC30A6Q6NXT4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC30A6Q6NXT4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC30A6Q6NXT4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC30A6Q6NXT4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC30A6Q6NXT4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC30A6Q6NXT4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC30A6Q6NXT4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC30A6Q6NXT4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC30A6Q6NXT4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC30A6Q6NXT4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC30A6Q6NXT4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC30A6Q6NXT4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC30A6Q6NXT4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC30A6Q6NXT4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC30A6Q6NXT4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC30A6Q6NXT4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC30A6Q6NXT4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC30A6Q6NXT4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC30A6Q6NXT4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC30A6Q6NXT4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC30A6Q6NXT4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC30A6Q6NXT4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC30A6Q6NXT4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC30A6Q6NXT4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC30A6Q6NXT4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC30A6Q6NXT4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC30A6Q6NXT4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC30A6Q6NXT4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC30A6Q6NXT4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC30A6Q6NXT4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC30A6Q6NXT4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC30A6Q6NXT4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC30A6Q6NXT4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC30A6Q6NXT4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC30A6Q6NXT4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC30A6Q6NXT4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC30A6Q6NXT4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC30A6Q6NXT4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC30A6Q6NXT4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC30A6Q6NXT4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC30A6Q6NXT4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC30A6Q6NXT4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC30A6Q6NXT4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC30A6Q6NXT4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC30A6Q6NXT4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC30A6Q6NXT4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC30A6Q6NXT4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC30A6Q6NXT4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC30A6Q6NXT4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC30A6Q6NXT4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC30A6Q6NXT4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC30A6Q6NXT4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC30A6Q6NXT4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC30A6Q6NXT4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms