Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUS6

TCTN3, Tectonic-3, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN3Q6NUS6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCTN3Q6NUS6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCTN3Q6NUS6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCTN3Q6NUS6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCTN3Q6NUS6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCTN3Q6NUS6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCTN3Q6NUS6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCTN3Q6NUS6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCTN3Q6NUS6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TCTN3Q6NUS6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCTN3Q6NUS6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCTN3Q6NUS6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCTN3Q6NUS6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TCTN3Q6NUS6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCTN3Q6NUS6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCTN3Q6NUS6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCTN3Q6NUS6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCTN3Q6NUS6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCTN3Q6NUS6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCTN3Q6NUS6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCTN3Q6NUS6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCTN3Q6NUS6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCTN3Q6NUS6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCTN3Q6NUS6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCTN3Q6NUS6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TCTN3Q6NUS6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCTN3Q6NUS6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCTN3Q6NUS6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TCTN3Q6NUS6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TCTN3Q6NUS6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCTN3Q6NUS6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCTN3Q6NUS6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCTN3Q6NUS6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCTN3Q6NUS6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCTN3Q6NUS6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCTN3Q6NUS6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCTN3Q6NUS6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCTN3Q6NUS6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCTN3Q6NUS6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCTN3Q6NUS6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCTN3Q6NUS6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCTN3Q6NUS6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCTN3Q6NUS6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCTN3Q6NUS6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCTN3Q6NUS6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCTN3Q6NUS6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCTN3Q6NUS6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCTN3Q6NUS6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCTN3Q6NUS6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCTN3Q6NUS6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCTN3Q6NUS6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCTN3Q6NUS6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TCTN3Q6NUS6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCTN3Q6NUS6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCTN3Q6NUS6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCTN3Q6NUS6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCTN3Q6NUS6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCTN3Q6NUS6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCTN3Q6NUS6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCTN3Q6NUS6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCTN3Q6NUS6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCTN3Q6NUS6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCTN3Q6NUS6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCTN3Q6NUS6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCTN3Q6NUS6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCTN3Q6NUS6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCTN3Q6NUS6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TCTN3Q6NUS6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCTN3Q6NUS6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCTN3Q6NUS6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCTN3Q6NUS6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TCTN3Q6NUS6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCTN3Q6NUS6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TCTN3Q6NUS6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCTN3Q6NUS6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCTN3Q6NUS6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCTN3Q6NUS6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCTN3Q6NUS6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCTN3Q6NUS6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCTN3Q6NUS6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCTN3Q6NUS6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCTN3Q6NUS6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TCTN3Q6NUS6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCTN3Q6NUS6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCTN3Q6NUS6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCTN3Q6NUS6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCTN3Q6NUS6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCTN3Q6NUS6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCTN3Q6NUS6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCTN3Q6NUS6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TCTN3Q6NUS6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCTN3Q6NUS6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCTN3Q6NUS6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TCTN3Q6NUS6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCTN3Q6NUS6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TCTN3Q6NUS6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCTN3Q6NUS6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCTN3Q6NUS6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCTN3Q6NUS6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCTN3Q6NUS6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms