Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICB0

DESI1, Desumoylating isopeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESI1Q6ICB0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DESI1Q6ICB0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DESI1Q6ICB0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DESI1Q6ICB0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DESI1Q6ICB0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DESI1Q6ICB0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DESI1Q6ICB0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DESI1Q6ICB0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DESI1Q6ICB0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DESI1Q6ICB0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DESI1Q6ICB0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DESI1Q6ICB0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DESI1Q6ICB0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DESI1Q6ICB0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DESI1Q6ICB0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DESI1Q6ICB0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DESI1Q6ICB0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DESI1Q6ICB0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DESI1Q6ICB0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DESI1Q6ICB0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DESI1Q6ICB0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DESI1Q6ICB0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DESI1Q6ICB0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DESI1Q6ICB0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DESI1Q6ICB0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DESI1Q6ICB0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DESI1Q6ICB0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DESI1Q6ICB0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DESI1Q6ICB0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DESI1Q6ICB0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DESI1Q6ICB0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DESI1Q6ICB0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DESI1Q6ICB0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DESI1Q6ICB0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DESI1Q6ICB0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DESI1Q6ICB0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DESI1Q6ICB0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DESI1Q6ICB0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DESI1Q6ICB0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DESI1Q6ICB0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DESI1Q6ICB0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DESI1Q6ICB0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DESI1Q6ICB0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DESI1Q6ICB0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DESI1Q6ICB0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DESI1Q6ICB0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DESI1Q6ICB0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DESI1Q6ICB0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DESI1Q6ICB0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DESI1Q6ICB0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DESI1Q6ICB0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DESI1Q6ICB0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DESI1Q6ICB0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DESI1Q6ICB0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DESI1Q6ICB0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DESI1Q6ICB0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DESI1Q6ICB0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DESI1Q6ICB0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DESI1Q6ICB0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DESI1Q6ICB0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DESI1Q6ICB0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DESI1Q6ICB0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DESI1Q6ICB0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DESI1Q6ICB0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DESI1Q6ICB0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DESI1Q6ICB0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DESI1Q6ICB0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DESI1Q6ICB0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DESI1Q6ICB0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DESI1Q6ICB0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DESI1Q6ICB0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DESI1Q6ICB0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DESI1Q6ICB0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DESI1Q6ICB0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DESI1Q6ICB0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DESI1Q6ICB0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DESI1Q6ICB0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DESI1Q6ICB0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DESI1Q6ICB0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DESI1Q6ICB0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DESI1Q6ICB0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DESI1Q6ICB0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DESI1Q6ICB0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DESI1Q6ICB0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DESI1Q6ICB0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DESI1Q6ICB0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DESI1Q6ICB0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DESI1Q6ICB0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DESI1Q6ICB0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DESI1Q6ICB0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DESI1Q6ICB0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DESI1Q6ICB0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DESI1Q6ICB0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DESI1Q6ICB0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DESI1Q6ICB0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DESI1Q6ICB0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DESI1Q6ICB0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DESI1Q6ICB0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DESI1Q6ICB0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DESI1Q6ICB0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.6 ms