Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
VIRMAQ69YN4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
VIRMAQ69YN4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
VIRMAQ69YN4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
VIRMAQ69YN4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
VIRMAQ69YN4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
VIRMAQ69YN4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
VIRMAQ69YN4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
VIRMAQ69YN4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.16
VIRMAQ69YN4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
VIRMAQ69YN4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
VIRMAQ69YN4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
VIRMAQ69YN4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
VIRMAQ69YN4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
VIRMAQ69YN4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
VIRMAQ69YN4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
VIRMAQ69YN4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
VIRMAQ69YN4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
VIRMAQ69YN4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
VIRMAQ69YN4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
VIRMAQ69YN4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
VIRMAQ69YN4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
VIRMAQ69YN4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
VIRMAQ69YN4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
VIRMAQ69YN4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
VIRMAQ69YN4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
VIRMAQ69YN4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
VIRMAQ69YN4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
VIRMAQ69YN4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
VIRMAQ69YN4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
VIRMAQ69YN4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.69■■■■□ 3.14
VIRMAQ69YN4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
VIRMAQ69YN4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
VIRMAQ69YN4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
VIRMAQ69YN4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
VIRMAQ69YN4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
VIRMAQ69YN4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
VIRMAQ69YN4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
VIRMAQ69YN4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
VIRMAQ69YN4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
VIRMAQ69YN4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
VIRMAQ69YN4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
VIRMAQ69YN4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
VIRMAQ69YN4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
VIRMAQ69YN4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
VIRMAQ69YN4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
VIRMAQ69YN4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
VIRMAQ69YN4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
VIRMAQ69YN4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
VIRMAQ69YN4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
VIRMAQ69YN4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
VIRMAQ69YN4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
VIRMAQ69YN4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
VIRMAQ69YN4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
VIRMAQ69YN4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
VIRMAQ69YN4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
VIRMAQ69YN4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
VIRMAQ69YN4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
VIRMAQ69YN4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
VIRMAQ69YN4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
VIRMAQ69YN4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
VIRMAQ69YN4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
VIRMAQ69YN4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
VIRMAQ69YN4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
VIRMAQ69YN4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
VIRMAQ69YN4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
VIRMAQ69YN4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
VIRMAQ69YN4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
VIRMAQ69YN4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC34.5■■■■□ 3.11
VIRMAQ69YN4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
VIRMAQ69YN4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
VIRMAQ69YN4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
VIRMAQ69YN4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
VIRMAQ69YN4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
VIRMAQ69YN4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
VIRMAQ69YN4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
VIRMAQ69YN4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
VIRMAQ69YN4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
VIRMAQ69YN4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
VIRMAQ69YN4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
VIRMAQ69YN4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
VIRMAQ69YN4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
VIRMAQ69YN4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
VIRMAQ69YN4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
VIRMAQ69YN4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
VIRMAQ69YN4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
VIRMAQ69YN4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
VIRMAQ69YN4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
VIRMAQ69YN4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
VIRMAQ69YN4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
VIRMAQ69YN4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
VIRMAQ69YN4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
VIRMAQ69YN4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
VIRMAQ69YN4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
VIRMAQ69YN4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
VIRMAQ69YN4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
VIRMAQ69YN4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
VIRMAQ69YN4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
VIRMAQ69YN4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
VIRMAQ69YN4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms