Protein–RNA interactions for Protein: Q68DU8

KCTD16, BTB/POZ domain-containing protein KCTD16, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD16Q68DU8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
KCTD16Q68DU8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCTD16Q68DU8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCTD16Q68DU8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCTD16Q68DU8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCTD16Q68DU8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCTD16Q68DU8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCTD16Q68DU8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCTD16Q68DU8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCTD16Q68DU8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
KCTD16Q68DU8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCTD16Q68DU8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCTD16Q68DU8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCTD16Q68DU8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCTD16Q68DU8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCTD16Q68DU8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCTD16Q68DU8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCTD16Q68DU8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCTD16Q68DU8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCTD16Q68DU8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCTD16Q68DU8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCTD16Q68DU8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCTD16Q68DU8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCTD16Q68DU8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCTD16Q68DU8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCTD16Q68DU8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCTD16Q68DU8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCTD16Q68DU8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCTD16Q68DU8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCTD16Q68DU8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCTD16Q68DU8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCTD16Q68DU8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCTD16Q68DU8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCTD16Q68DU8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCTD16Q68DU8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCTD16Q68DU8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCTD16Q68DU8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCTD16Q68DU8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCTD16Q68DU8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCTD16Q68DU8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCTD16Q68DU8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCTD16Q68DU8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCTD16Q68DU8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCTD16Q68DU8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCTD16Q68DU8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCTD16Q68DU8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCTD16Q68DU8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCTD16Q68DU8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCTD16Q68DU8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCTD16Q68DU8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCTD16Q68DU8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCTD16Q68DU8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCTD16Q68DU8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCTD16Q68DU8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCTD16Q68DU8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCTD16Q68DU8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCTD16Q68DU8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCTD16Q68DU8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCTD16Q68DU8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCTD16Q68DU8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCTD16Q68DU8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCTD16Q68DU8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCTD16Q68DU8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
KCTD16Q68DU8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCTD16Q68DU8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCTD16Q68DU8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCTD16Q68DU8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCTD16Q68DU8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCTD16Q68DU8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCTD16Q68DU8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCTD16Q68DU8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCTD16Q68DU8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCTD16Q68DU8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCTD16Q68DU8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCTD16Q68DU8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCTD16Q68DU8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KCTD16Q68DU8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCTD16Q68DU8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCTD16Q68DU8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCTD16Q68DU8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCTD16Q68DU8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCTD16Q68DU8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCTD16Q68DU8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCTD16Q68DU8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCTD16Q68DU8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCTD16Q68DU8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCTD16Q68DU8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCTD16Q68DU8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCTD16Q68DU8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCTD16Q68DU8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCTD16Q68DU8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KCTD16Q68DU8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCTD16Q68DU8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCTD16Q68DU8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCTD16Q68DU8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCTD16Q68DU8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
KCTD16Q68DU8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCTD16Q68DU8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCTD16Q68DU8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCTD16Q68DU8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms