Protein–RNA interactions for Protein: Q5TZA2

CROCC, Rootletin, humanhuman

Predictions only

Length 2,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCCQ5TZA2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CROCCQ5TZA2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CROCCQ5TZA2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CROCCQ5TZA2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CROCCQ5TZA2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CROCCQ5TZA2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCCQ5TZA2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCCQ5TZA2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCCQ5TZA2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CROCCQ5TZA2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CROCCQ5TZA2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CROCCQ5TZA2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CROCCQ5TZA2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CROCCQ5TZA2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CROCCQ5TZA2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CROCCQ5TZA2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CROCCQ5TZA2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CROCCQ5TZA2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CROCCQ5TZA2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CROCCQ5TZA2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CROCCQ5TZA2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CROCCQ5TZA2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CROCCQ5TZA2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CROCCQ5TZA2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CROCCQ5TZA2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CROCCQ5TZA2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CROCCQ5TZA2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CROCCQ5TZA2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CROCCQ5TZA2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CROCCQ5TZA2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CROCCQ5TZA2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CROCCQ5TZA2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CROCCQ5TZA2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CROCCQ5TZA2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CROCCQ5TZA2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CROCCQ5TZA2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CROCCQ5TZA2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CROCCQ5TZA2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CROCCQ5TZA2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CROCCQ5TZA2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CROCCQ5TZA2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CROCCQ5TZA2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CROCCQ5TZA2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CROCCQ5TZA2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CROCCQ5TZA2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CROCCQ5TZA2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CROCCQ5TZA2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CROCCQ5TZA2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CROCCQ5TZA2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CROCCQ5TZA2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CROCCQ5TZA2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CROCCQ5TZA2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CROCCQ5TZA2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CROCCQ5TZA2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CROCCQ5TZA2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CROCCQ5TZA2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CROCCQ5TZA2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CROCCQ5TZA2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CROCCQ5TZA2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CROCCQ5TZA2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CROCCQ5TZA2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CROCCQ5TZA2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CROCCQ5TZA2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CROCCQ5TZA2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CROCCQ5TZA2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CROCCQ5TZA2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CROCCQ5TZA2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CROCCQ5TZA2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CROCCQ5TZA2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CROCCQ5TZA2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CROCCQ5TZA2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CROCCQ5TZA2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CROCCQ5TZA2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CROCCQ5TZA2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CROCCQ5TZA2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CROCCQ5TZA2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CROCCQ5TZA2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CROCCQ5TZA2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CROCCQ5TZA2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CROCCQ5TZA2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CROCCQ5TZA2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CROCCQ5TZA2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CROCCQ5TZA2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CROCCQ5TZA2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CROCCQ5TZA2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CROCCQ5TZA2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CROCCQ5TZA2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CROCCQ5TZA2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CROCCQ5TZA2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CROCCQ5TZA2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CROCCQ5TZA2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CROCCQ5TZA2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CROCCQ5TZA2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CROCCQ5TZA2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CROCCQ5TZA2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CROCCQ5TZA2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CROCCQ5TZA2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CROCCQ5TZA2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CROCCQ5TZA2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CROCCQ5TZA2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms