Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC12

ATPAF1, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPAF1Q5TC12 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATPAF1Q5TC12 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATPAF1Q5TC12 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATPAF1Q5TC12 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATPAF1Q5TC12 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATPAF1Q5TC12 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATPAF1Q5TC12 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATPAF1Q5TC12 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATPAF1Q5TC12 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATPAF1Q5TC12 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATPAF1Q5TC12 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATPAF1Q5TC12 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATPAF1Q5TC12 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATPAF1Q5TC12 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATPAF1Q5TC12 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATPAF1Q5TC12 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATPAF1Q5TC12 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATPAF1Q5TC12 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATPAF1Q5TC12 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATPAF1Q5TC12 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATPAF1Q5TC12 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATPAF1Q5TC12 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATPAF1Q5TC12 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATPAF1Q5TC12 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATPAF1Q5TC12 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATPAF1Q5TC12 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATPAF1Q5TC12 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATPAF1Q5TC12 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATPAF1Q5TC12 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATPAF1Q5TC12 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATPAF1Q5TC12 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATPAF1Q5TC12 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATPAF1Q5TC12 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATPAF1Q5TC12 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATPAF1Q5TC12 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATPAF1Q5TC12 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATPAF1Q5TC12 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATPAF1Q5TC12 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATPAF1Q5TC12 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATPAF1Q5TC12 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATPAF1Q5TC12 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATPAF1Q5TC12 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATPAF1Q5TC12 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATPAF1Q5TC12 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATPAF1Q5TC12 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATPAF1Q5TC12 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATPAF1Q5TC12 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATPAF1Q5TC12 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATPAF1Q5TC12 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATPAF1Q5TC12 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATPAF1Q5TC12 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATPAF1Q5TC12 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATPAF1Q5TC12 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATPAF1Q5TC12 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATPAF1Q5TC12 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATPAF1Q5TC12 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATPAF1Q5TC12 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATPAF1Q5TC12 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATPAF1Q5TC12 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATPAF1Q5TC12 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATPAF1Q5TC12 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATPAF1Q5TC12 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATPAF1Q5TC12 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATPAF1Q5TC12 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATPAF1Q5TC12 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATPAF1Q5TC12 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATPAF1Q5TC12 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATPAF1Q5TC12 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATPAF1Q5TC12 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATPAF1Q5TC12 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATPAF1Q5TC12 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATPAF1Q5TC12 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATPAF1Q5TC12 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATPAF1Q5TC12 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATPAF1Q5TC12 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATPAF1Q5TC12 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATPAF1Q5TC12 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATPAF1Q5TC12 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATPAF1Q5TC12 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATPAF1Q5TC12 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATPAF1Q5TC12 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATPAF1Q5TC12 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATPAF1Q5TC12 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATPAF1Q5TC12 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATPAF1Q5TC12 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATPAF1Q5TC12 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATPAF1Q5TC12 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATPAF1Q5TC12 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATPAF1Q5TC12 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATPAF1Q5TC12 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATPAF1Q5TC12 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATPAF1Q5TC12 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATPAF1Q5TC12 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATPAF1Q5TC12 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATPAF1Q5TC12 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATPAF1Q5TC12 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATPAF1Q5TC12 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATPAF1Q5TC12 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATPAF1Q5TC12 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATPAF1Q5TC12 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms