Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYCP2LQ5T4T6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYCP2LQ5T4T6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYCP2LQ5T4T6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYCP2LQ5T4T6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYCP2LQ5T4T6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCP2LQ5T4T6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCP2LQ5T4T6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCP2LQ5T4T6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYCP2LQ5T4T6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYCP2LQ5T4T6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYCP2LQ5T4T6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYCP2LQ5T4T6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYCP2LQ5T4T6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYCP2LQ5T4T6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYCP2LQ5T4T6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYCP2LQ5T4T6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCP2LQ5T4T6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCP2LQ5T4T6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCP2LQ5T4T6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCP2LQ5T4T6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCP2LQ5T4T6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYCP2LQ5T4T6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SYCP2LQ5T4T6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYCP2LQ5T4T6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYCP2LQ5T4T6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYCP2LQ5T4T6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYCP2LQ5T4T6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYCP2LQ5T4T6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYCP2LQ5T4T6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYCP2LQ5T4T6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYCP2LQ5T4T6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYCP2LQ5T4T6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYCP2LQ5T4T6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYCP2LQ5T4T6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYCP2LQ5T4T6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCP2LQ5T4T6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCP2LQ5T4T6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCP2LQ5T4T6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYCP2LQ5T4T6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYCP2LQ5T4T6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SYCP2LQ5T4T6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYCP2LQ5T4T6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYCP2LQ5T4T6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYCP2LQ5T4T6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYCP2LQ5T4T6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP2LQ5T4T6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP2LQ5T4T6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCP2LQ5T4T6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCP2LQ5T4T6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCP2LQ5T4T6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCP2LQ5T4T6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYCP2LQ5T4T6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYCP2LQ5T4T6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYCP2LQ5T4T6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYCP2LQ5T4T6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYCP2LQ5T4T6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCP2LQ5T4T6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCP2LQ5T4T6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYCP2LQ5T4T6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYCP2LQ5T4T6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYCP2LQ5T4T6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP2LQ5T4T6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP2LQ5T4T6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP2LQ5T4T6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP2LQ5T4T6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP2LQ5T4T6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP2LQ5T4T6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP2LQ5T4T6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP2LQ5T4T6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP2LQ5T4T6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYCP2LQ5T4T6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYCP2LQ5T4T6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SYCP2LQ5T4T6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYCP2LQ5T4T6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYCP2LQ5T4T6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYCP2LQ5T4T6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYCP2LQ5T4T6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYCP2LQ5T4T6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYCP2LQ5T4T6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYCP2LQ5T4T6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYCP2LQ5T4T6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYCP2LQ5T4T6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYCP2LQ5T4T6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYCP2LQ5T4T6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SYCP2LQ5T4T6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYCP2LQ5T4T6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYCP2LQ5T4T6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYCP2LQ5T4T6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYCP2LQ5T4T6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYCP2LQ5T4T6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCP2LQ5T4T6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCP2LQ5T4T6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCP2LQ5T4T6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCP2LQ5T4T6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCP2LQ5T4T6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYCP2LQ5T4T6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYCP2LQ5T4T6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYCP2LQ5T4T6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYCP2LQ5T4T6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms