Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC122Q5T0U0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC122Q5T0U0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC122Q5T0U0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC122Q5T0U0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC122Q5T0U0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC122Q5T0U0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC122Q5T0U0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC122Q5T0U0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC122Q5T0U0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC122Q5T0U0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC122Q5T0U0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC122Q5T0U0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC122Q5T0U0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC122Q5T0U0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC122Q5T0U0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC122Q5T0U0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC122Q5T0U0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC122Q5T0U0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC122Q5T0U0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC122Q5T0U0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC122Q5T0U0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC122Q5T0U0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC122Q5T0U0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC122Q5T0U0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC122Q5T0U0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC122Q5T0U0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC122Q5T0U0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC122Q5T0U0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC122Q5T0U0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC122Q5T0U0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC122Q5T0U0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC122Q5T0U0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC122Q5T0U0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC122Q5T0U0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC122Q5T0U0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC122Q5T0U0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC122Q5T0U0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC122Q5T0U0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC122Q5T0U0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC122Q5T0U0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC122Q5T0U0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC122Q5T0U0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC122Q5T0U0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC122Q5T0U0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC122Q5T0U0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC122Q5T0U0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC122Q5T0U0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC122Q5T0U0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CCDC122Q5T0U0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC122Q5T0U0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC122Q5T0U0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC122Q5T0U0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC122Q5T0U0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC122Q5T0U0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC122Q5T0U0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC122Q5T0U0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC122Q5T0U0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC122Q5T0U0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC122Q5T0U0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC122Q5T0U0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC122Q5T0U0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC122Q5T0U0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC122Q5T0U0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC122Q5T0U0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC122Q5T0U0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC122Q5T0U0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC122Q5T0U0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC122Q5T0U0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC122Q5T0U0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC122Q5T0U0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC122Q5T0U0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC122Q5T0U0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC122Q5T0U0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC122Q5T0U0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC122Q5T0U0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC122Q5T0U0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC122Q5T0U0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC122Q5T0U0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC122Q5T0U0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC122Q5T0U0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC122Q5T0U0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC122Q5T0U0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC122Q5T0U0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC122Q5T0U0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC122Q5T0U0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC122Q5T0U0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC122Q5T0U0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC122Q5T0U0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC122Q5T0U0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC122Q5T0U0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC122Q5T0U0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC122Q5T0U0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC122Q5T0U0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC122Q5T0U0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC122Q5T0U0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC122Q5T0U0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC122Q5T0U0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC122Q5T0U0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC122Q5T0U0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms