Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIA9

CBWD5, COBW domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBWD5Q5RIA9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CBWD5Q5RIA9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CBWD5Q5RIA9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CBWD5Q5RIA9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CBWD5Q5RIA9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CBWD5Q5RIA9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CBWD5Q5RIA9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CBWD5Q5RIA9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CBWD5Q5RIA9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CBWD5Q5RIA9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CBWD5Q5RIA9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CBWD5Q5RIA9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CBWD5Q5RIA9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CBWD5Q5RIA9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CBWD5Q5RIA9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CBWD5Q5RIA9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CBWD5Q5RIA9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CBWD5Q5RIA9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CBWD5Q5RIA9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CBWD5Q5RIA9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CBWD5Q5RIA9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CBWD5Q5RIA9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CBWD5Q5RIA9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CBWD5Q5RIA9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CBWD5Q5RIA9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CBWD5Q5RIA9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CBWD5Q5RIA9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CBWD5Q5RIA9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CBWD5Q5RIA9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CBWD5Q5RIA9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CBWD5Q5RIA9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CBWD5Q5RIA9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CBWD5Q5RIA9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CBWD5Q5RIA9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CBWD5Q5RIA9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CBWD5Q5RIA9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CBWD5Q5RIA9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CBWD5Q5RIA9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CBWD5Q5RIA9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CBWD5Q5RIA9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CBWD5Q5RIA9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CBWD5Q5RIA9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CBWD5Q5RIA9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CBWD5Q5RIA9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CBWD5Q5RIA9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CBWD5Q5RIA9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CBWD5Q5RIA9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CBWD5Q5RIA9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CBWD5Q5RIA9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CBWD5Q5RIA9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CBWD5Q5RIA9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CBWD5Q5RIA9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CBWD5Q5RIA9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CBWD5Q5RIA9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CBWD5Q5RIA9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CBWD5Q5RIA9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CBWD5Q5RIA9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CBWD5Q5RIA9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CBWD5Q5RIA9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CBWD5Q5RIA9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CBWD5Q5RIA9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CBWD5Q5RIA9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CBWD5Q5RIA9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CBWD5Q5RIA9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CBWD5Q5RIA9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CBWD5Q5RIA9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CBWD5Q5RIA9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CBWD5Q5RIA9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CBWD5Q5RIA9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CBWD5Q5RIA9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CBWD5Q5RIA9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CBWD5Q5RIA9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CBWD5Q5RIA9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CBWD5Q5RIA9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CBWD5Q5RIA9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CBWD5Q5RIA9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CBWD5Q5RIA9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CBWD5Q5RIA9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CBWD5Q5RIA9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CBWD5Q5RIA9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CBWD5Q5RIA9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CBWD5Q5RIA9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CBWD5Q5RIA9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CBWD5Q5RIA9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CBWD5Q5RIA9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CBWD5Q5RIA9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CBWD5Q5RIA9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CBWD5Q5RIA9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CBWD5Q5RIA9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CBWD5Q5RIA9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CBWD5Q5RIA9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CBWD5Q5RIA9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CBWD5Q5RIA9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CBWD5Q5RIA9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CBWD5Q5RIA9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CBWD5Q5RIA9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CBWD5Q5RIA9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CBWD5Q5RIA9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CBWD5Q5RIA9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CBWD5Q5RIA9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms