Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAN3Q58A45 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAN3Q58A45 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAN3Q58A45 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAN3Q58A45 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAN3Q58A45 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAN3Q58A45 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAN3Q58A45 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAN3Q58A45 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAN3Q58A45 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAN3Q58A45 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAN3Q58A45 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAN3Q58A45 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAN3Q58A45 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAN3Q58A45 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAN3Q58A45 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAN3Q58A45 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAN3Q58A45 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAN3Q58A45 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAN3Q58A45 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAN3Q58A45 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAN3Q58A45 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAN3Q58A45 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAN3Q58A45 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAN3Q58A45 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAN3Q58A45 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAN3Q58A45 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAN3Q58A45 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAN3Q58A45 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAN3Q58A45 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAN3Q58A45 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PAN3Q58A45 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAN3Q58A45 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAN3Q58A45 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAN3Q58A45 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAN3Q58A45 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAN3Q58A45 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAN3Q58A45 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAN3Q58A45 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAN3Q58A45 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAN3Q58A45 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAN3Q58A45 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAN3Q58A45 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAN3Q58A45 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAN3Q58A45 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAN3Q58A45 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAN3Q58A45 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAN3Q58A45 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAN3Q58A45 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAN3Q58A45 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PAN3Q58A45 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAN3Q58A45 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAN3Q58A45 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAN3Q58A45 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAN3Q58A45 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAN3Q58A45 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAN3Q58A45 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAN3Q58A45 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAN3Q58A45 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAN3Q58A45 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAN3Q58A45 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAN3Q58A45 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAN3Q58A45 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAN3Q58A45 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAN3Q58A45 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAN3Q58A45 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAN3Q58A45 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PAN3Q58A45 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAN3Q58A45 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PAN3Q58A45 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAN3Q58A45 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAN3Q58A45 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAN3Q58A45 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAN3Q58A45 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAN3Q58A45 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAN3Q58A45 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAN3Q58A45 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAN3Q58A45 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAN3Q58A45 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAN3Q58A45 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAN3Q58A45 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PAN3Q58A45 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAN3Q58A45 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAN3Q58A45 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAN3Q58A45 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAN3Q58A45 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PAN3Q58A45 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAN3Q58A45 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAN3Q58A45 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAN3Q58A45 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PAN3Q58A45 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAN3Q58A45 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAN3Q58A45 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAN3Q58A45 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAN3Q58A45 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAN3Q58A45 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAN3Q58A45 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAN3Q58A45 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAN3Q58A45 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAN3Q58A45 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms