Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GREB1Q4ZG55 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GREB1Q4ZG55 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GREB1Q4ZG55 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GREB1Q4ZG55 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GREB1Q4ZG55 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GREB1Q4ZG55 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GREB1Q4ZG55 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GREB1Q4ZG55 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GREB1Q4ZG55 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
GREB1Q4ZG55 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GREB1Q4ZG55 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GREB1Q4ZG55 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GREB1Q4ZG55 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GREB1Q4ZG55 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GREB1Q4ZG55 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GREB1Q4ZG55 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GREB1Q4ZG55 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GREB1Q4ZG55 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GREB1Q4ZG55 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GREB1Q4ZG55 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GREB1Q4ZG55 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GREB1Q4ZG55 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GREB1Q4ZG55 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GREB1Q4ZG55 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GREB1Q4ZG55 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GREB1Q4ZG55 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GREB1Q4ZG55 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GREB1Q4ZG55 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GREB1Q4ZG55 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GREB1Q4ZG55 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GREB1Q4ZG55 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GREB1Q4ZG55 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GREB1Q4ZG55 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GREB1Q4ZG55 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GREB1Q4ZG55 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GREB1Q4ZG55 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GREB1Q4ZG55 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GREB1Q4ZG55 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GREB1Q4ZG55 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GREB1Q4ZG55 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
GREB1Q4ZG55 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GREB1Q4ZG55 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GREB1Q4ZG55 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
GREB1Q4ZG55 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GREB1Q4ZG55 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GREB1Q4ZG55 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
GREB1Q4ZG55 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GREB1Q4ZG55 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GREB1Q4ZG55 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GREB1Q4ZG55 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GREB1Q4ZG55 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GREB1Q4ZG55 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
GREB1Q4ZG55 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GREB1Q4ZG55 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
GREB1Q4ZG55 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GREB1Q4ZG55 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GREB1Q4ZG55 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GREB1Q4ZG55 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GREB1Q4ZG55 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GREB1Q4ZG55 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GREB1Q4ZG55 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GREB1Q4ZG55 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GREB1Q4ZG55 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GREB1Q4ZG55 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GREB1Q4ZG55 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GREB1Q4ZG55 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GREB1Q4ZG55 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GREB1Q4ZG55 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GREB1Q4ZG55 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GREB1Q4ZG55 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GREB1Q4ZG55 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GREB1Q4ZG55 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GREB1Q4ZG55 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GREB1Q4ZG55 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GREB1Q4ZG55 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GREB1Q4ZG55 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GREB1Q4ZG55 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GREB1Q4ZG55 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GREB1Q4ZG55 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GREB1Q4ZG55 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GREB1Q4ZG55 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GREB1Q4ZG55 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GREB1Q4ZG55 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GREB1Q4ZG55 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GREB1Q4ZG55 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GREB1Q4ZG55 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GREB1Q4ZG55 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GREB1Q4ZG55 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GREB1Q4ZG55 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GREB1Q4ZG55 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GREB1Q4ZG55 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GREB1Q4ZG55 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GREB1Q4ZG55 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GREB1Q4ZG55 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GREB1Q4ZG55 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
GREB1Q4ZG55 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
GREB1Q4ZG55 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
GREB1Q4ZG55 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GREB1Q4ZG55 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms