Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFAP221Q4G0U5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFAP221Q4G0U5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFAP221Q4G0U5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFAP221Q4G0U5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFAP221Q4G0U5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFAP221Q4G0U5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFAP221Q4G0U5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFAP221Q4G0U5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CFAP221Q4G0U5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFAP221Q4G0U5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFAP221Q4G0U5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFAP221Q4G0U5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CFAP221Q4G0U5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CFAP221Q4G0U5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CFAP221Q4G0U5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CFAP221Q4G0U5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFAP221Q4G0U5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFAP221Q4G0U5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFAP221Q4G0U5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFAP221Q4G0U5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFAP221Q4G0U5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFAP221Q4G0U5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CFAP221Q4G0U5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFAP221Q4G0U5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CFAP221Q4G0U5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CFAP221Q4G0U5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CFAP221Q4G0U5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CFAP221Q4G0U5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP221Q4G0U5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP221Q4G0U5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP221Q4G0U5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP221Q4G0U5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFAP221Q4G0U5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFAP221Q4G0U5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFAP221Q4G0U5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP221Q4G0U5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP221Q4G0U5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP221Q4G0U5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP221Q4G0U5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFAP221Q4G0U5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFAP221Q4G0U5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFAP221Q4G0U5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFAP221Q4G0U5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFAP221Q4G0U5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP221Q4G0U5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP221Q4G0U5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP221Q4G0U5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP221Q4G0U5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP221Q4G0U5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP221Q4G0U5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP221Q4G0U5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CFAP221Q4G0U5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFAP221Q4G0U5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFAP221Q4G0U5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP221Q4G0U5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP221Q4G0U5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP221Q4G0U5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP221Q4G0U5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP221Q4G0U5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP221Q4G0U5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP221Q4G0U5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP221Q4G0U5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFAP221Q4G0U5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFAP221Q4G0U5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFAP221Q4G0U5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFAP221Q4G0U5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFAP221Q4G0U5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFAP221Q4G0U5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFAP221Q4G0U5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFAP221Q4G0U5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFAP221Q4G0U5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFAP221Q4G0U5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFAP221Q4G0U5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFAP221Q4G0U5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFAP221Q4G0U5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFAP221Q4G0U5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFAP221Q4G0U5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFAP221Q4G0U5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFAP221Q4G0U5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFAP221Q4G0U5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFAP221Q4G0U5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFAP221Q4G0U5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFAP221Q4G0U5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CFAP221Q4G0U5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CFAP221Q4G0U5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CFAP221Q4G0U5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP221Q4G0U5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP221Q4G0U5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP221Q4G0U5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP221Q4G0U5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP221Q4G0U5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP221Q4G0U5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP221Q4G0U5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP221Q4G0U5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP221Q4G0U5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP221Q4G0U5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP221Q4G0U5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP221Q4G0U5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP221Q4G0U5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms