Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCQ8

TIMM50, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50Q3ZCQ8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIMM50Q3ZCQ8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIMM50Q3ZCQ8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TIMM50Q3ZCQ8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIMM50Q3ZCQ8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIMM50Q3ZCQ8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIMM50Q3ZCQ8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIMM50Q3ZCQ8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIMM50Q3ZCQ8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMM50Q3ZCQ8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMM50Q3ZCQ8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMM50Q3ZCQ8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIMM50Q3ZCQ8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TIMM50Q3ZCQ8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIMM50Q3ZCQ8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIMM50Q3ZCQ8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIMM50Q3ZCQ8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIMM50Q3ZCQ8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIMM50Q3ZCQ8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIMM50Q3ZCQ8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIMM50Q3ZCQ8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIMM50Q3ZCQ8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIMM50Q3ZCQ8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIMM50Q3ZCQ8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMM50Q3ZCQ8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMM50Q3ZCQ8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMM50Q3ZCQ8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMM50Q3ZCQ8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMM50Q3ZCQ8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMM50Q3ZCQ8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMM50Q3ZCQ8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMM50Q3ZCQ8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMM50Q3ZCQ8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMM50Q3ZCQ8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMM50Q3ZCQ8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMM50Q3ZCQ8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TIMM50Q3ZCQ8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TIMM50Q3ZCQ8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TIMM50Q3ZCQ8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMM50Q3ZCQ8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMM50Q3ZCQ8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMM50Q3ZCQ8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMM50Q3ZCQ8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMM50Q3ZCQ8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMM50Q3ZCQ8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMM50Q3ZCQ8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMM50Q3ZCQ8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMM50Q3ZCQ8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMM50Q3ZCQ8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMM50Q3ZCQ8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMM50Q3ZCQ8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMM50Q3ZCQ8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TIMM50Q3ZCQ8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TIMM50Q3ZCQ8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TIMM50Q3ZCQ8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TIMM50Q3ZCQ8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TIMM50Q3ZCQ8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TIMM50Q3ZCQ8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIMM50Q3ZCQ8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIMM50Q3ZCQ8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIMM50Q3ZCQ8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIMM50Q3ZCQ8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIMM50Q3ZCQ8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIMM50Q3ZCQ8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIMM50Q3ZCQ8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMM50Q3ZCQ8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMM50Q3ZCQ8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMM50Q3ZCQ8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMM50Q3ZCQ8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMM50Q3ZCQ8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMM50Q3ZCQ8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMM50Q3ZCQ8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMM50Q3ZCQ8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMM50Q3ZCQ8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMM50Q3ZCQ8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TIMM50Q3ZCQ8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMM50Q3ZCQ8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMM50Q3ZCQ8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMM50Q3ZCQ8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMM50Q3ZCQ8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMM50Q3ZCQ8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMM50Q3ZCQ8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMM50Q3ZCQ8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMM50Q3ZCQ8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMM50Q3ZCQ8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMM50Q3ZCQ8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMM50Q3ZCQ8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TIMM50Q3ZCQ8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TIMM50Q3ZCQ8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TIMM50Q3ZCQ8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TIMM50Q3ZCQ8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TIMM50Q3ZCQ8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TIMM50Q3ZCQ8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TIMM50Q3ZCQ8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TIMM50Q3ZCQ8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TIMM50Q3ZCQ8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TIMM50Q3ZCQ8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TIMM50Q3ZCQ8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TIMM50Q3ZCQ8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TIMM50Q3ZCQ8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms