Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SP6Q3SY56 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SP6Q3SY56 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SP6Q3SY56 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SP6Q3SY56 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SP6Q3SY56 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SP6Q3SY56 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SP6Q3SY56 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SP6Q3SY56 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SP6Q3SY56 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SP6Q3SY56 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SP6Q3SY56 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SP6Q3SY56 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SP6Q3SY56 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SP6Q3SY56 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SP6Q3SY56 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SP6Q3SY56 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SP6Q3SY56 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SP6Q3SY56 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SP6Q3SY56 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SP6Q3SY56 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SP6Q3SY56 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SP6Q3SY56 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SP6Q3SY56 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP6Q3SY56 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP6Q3SY56 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP6Q3SY56 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP6Q3SY56 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP6Q3SY56 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP6Q3SY56 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP6Q3SY56 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP6Q3SY56 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP6Q3SY56 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SP6Q3SY56 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SP6Q3SY56 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SP6Q3SY56 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SP6Q3SY56 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SP6Q3SY56 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SP6Q3SY56 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SP6Q3SY56 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SP6Q3SY56 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SP6Q3SY56 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SP6Q3SY56 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SP6Q3SY56 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SP6Q3SY56 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SP6Q3SY56 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SP6Q3SY56 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SP6Q3SY56 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SP6Q3SY56 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SP6Q3SY56 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SP6Q3SY56 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SP6Q3SY56 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SP6Q3SY56 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SP6Q3SY56 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SP6Q3SY56 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SP6Q3SY56 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SP6Q3SY56 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SP6Q3SY56 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SP6Q3SY56 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SP6Q3SY56 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SP6Q3SY56 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SP6Q3SY56 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SP6Q3SY56 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SP6Q3SY56 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SP6Q3SY56 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SP6Q3SY56 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SP6Q3SY56 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SP6Q3SY56 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SP6Q3SY56 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SP6Q3SY56 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SP6Q3SY56 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SP6Q3SY56 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SP6Q3SY56 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SP6Q3SY56 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SP6Q3SY56 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SP6Q3SY56 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SP6Q3SY56 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SP6Q3SY56 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SP6Q3SY56 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SP6Q3SY56 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SP6Q3SY56 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SP6Q3SY56 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SP6Q3SY56 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SP6Q3SY56 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SP6Q3SY56 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SP6Q3SY56 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SP6Q3SY56 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SP6Q3SY56 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SP6Q3SY56 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SP6Q3SY56 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SP6Q3SY56 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SP6Q3SY56 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SP6Q3SY56 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SP6Q3SY56 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SP6Q3SY56 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms