Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7S5

SMIM21, Small integral membrane protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM21Q3B7S5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM21Q3B7S5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM21Q3B7S5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM21Q3B7S5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM21Q3B7S5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM21Q3B7S5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM21Q3B7S5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM21Q3B7S5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM21Q3B7S5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM21Q3B7S5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM21Q3B7S5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM21Q3B7S5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM21Q3B7S5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM21Q3B7S5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM21Q3B7S5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM21Q3B7S5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM21Q3B7S5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM21Q3B7S5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM21Q3B7S5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM21Q3B7S5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM21Q3B7S5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM21Q3B7S5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM21Q3B7S5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM21Q3B7S5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMIM21Q3B7S5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM21Q3B7S5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM21Q3B7S5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM21Q3B7S5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM21Q3B7S5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM21Q3B7S5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM21Q3B7S5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM21Q3B7S5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM21Q3B7S5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM21Q3B7S5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM21Q3B7S5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM21Q3B7S5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM21Q3B7S5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM21Q3B7S5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM21Q3B7S5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM21Q3B7S5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM21Q3B7S5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM21Q3B7S5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM21Q3B7S5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM21Q3B7S5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM21Q3B7S5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM21Q3B7S5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM21Q3B7S5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM21Q3B7S5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM21Q3B7S5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM21Q3B7S5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM21Q3B7S5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM21Q3B7S5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM21Q3B7S5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM21Q3B7S5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM21Q3B7S5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM21Q3B7S5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM21Q3B7S5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM21Q3B7S5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM21Q3B7S5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM21Q3B7S5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM21Q3B7S5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM21Q3B7S5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM21Q3B7S5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM21Q3B7S5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM21Q3B7S5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM21Q3B7S5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM21Q3B7S5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM21Q3B7S5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM21Q3B7S5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM21Q3B7S5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM21Q3B7S5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM21Q3B7S5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM21Q3B7S5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM21Q3B7S5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMIM21Q3B7S5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMIM21Q3B7S5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMIM21Q3B7S5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMIM21Q3B7S5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMIM21Q3B7S5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMIM21Q3B7S5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMIM21Q3B7S5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMIM21Q3B7S5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMIM21Q3B7S5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMIM21Q3B7S5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMIM21Q3B7S5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMIM21Q3B7S5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMIM21Q3B7S5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMIM21Q3B7S5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SMIM21Q3B7S5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMIM21Q3B7S5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMIM21Q3B7S5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM21Q3B7S5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM21Q3B7S5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM21Q3B7S5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMIM21Q3B7S5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMIM21Q3B7S5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMIM21Q3B7S5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMIM21Q3B7S5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMIM21Q3B7S5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SMIM21Q3B7S5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms