Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
P3H1Q32P28 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
P3H1Q32P28 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
P3H1Q32P28 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
P3H1Q32P28 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
P3H1Q32P28 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
P3H1Q32P28 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
P3H1Q32P28 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
P3H1Q32P28 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
P3H1Q32P28 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
P3H1Q32P28 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
P3H1Q32P28 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
P3H1Q32P28 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
P3H1Q32P28 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27■■□□□ 1.91
P3H1Q32P28 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
P3H1Q32P28 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
P3H1Q32P28 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
P3H1Q32P28 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
P3H1Q32P28 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
P3H1Q32P28 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
P3H1Q32P28 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
P3H1Q32P28 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
P3H1Q32P28 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
P3H1Q32P28 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
P3H1Q32P28 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
P3H1Q32P28 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
P3H1Q32P28 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
P3H1Q32P28 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
P3H1Q32P28 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
P3H1Q32P28 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
P3H1Q32P28 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
P3H1Q32P28 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
P3H1Q32P28 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
P3H1Q32P28 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
P3H1Q32P28 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
P3H1Q32P28 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
P3H1Q32P28 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
P3H1Q32P28 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
P3H1Q32P28 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
P3H1Q32P28 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
P3H1Q32P28 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
P3H1Q32P28 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
P3H1Q32P28 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
P3H1Q32P28 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
P3H1Q32P28 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
P3H1Q32P28 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
P3H1Q32P28 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
P3H1Q32P28 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
P3H1Q32P28 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
P3H1Q32P28 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
P3H1Q32P28 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
P3H1Q32P28 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
P3H1Q32P28 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
P3H1Q32P28 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
P3H1Q32P28 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
P3H1Q32P28 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
P3H1Q32P28 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
P3H1Q32P28 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
P3H1Q32P28 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
P3H1Q32P28 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
P3H1Q32P28 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
P3H1Q32P28 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
P3H1Q32P28 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
P3H1Q32P28 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
P3H1Q32P28 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
P3H1Q32P28 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
P3H1Q32P28 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
P3H1Q32P28 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
P3H1Q32P28 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
P3H1Q32P28 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
P3H1Q32P28 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
P3H1Q32P28 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
P3H1Q32P28 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
P3H1Q32P28 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
P3H1Q32P28 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
P3H1Q32P28 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
P3H1Q32P28 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
P3H1Q32P28 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
P3H1Q32P28 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
P3H1Q32P28 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
P3H1Q32P28 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
P3H1Q32P28 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
P3H1Q32P28 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
P3H1Q32P28 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
P3H1Q32P28 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
P3H1Q32P28 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
P3H1Q32P28 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
P3H1Q32P28 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
P3H1Q32P28 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
P3H1Q32P28 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
P3H1Q32P28 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
P3H1Q32P28 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
P3H1Q32P28 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
P3H1Q32P28 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
P3H1Q32P28 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
P3H1Q32P28 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
P3H1Q32P28 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
P3H1Q32P28 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
P3H1Q32P28 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
P3H1Q32P28 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms