Protein–RNA interactions for Protein: Q29980

MICB, MHC class I polypeptide-related sequence B, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICBQ29980 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MICBQ29980 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MICBQ29980 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MICBQ29980 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MICBQ29980 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MICBQ29980 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MICBQ29980 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MICBQ29980 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MICBQ29980 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MICBQ29980 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MICBQ29980 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MICBQ29980 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MICBQ29980 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MICBQ29980 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MICBQ29980 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MICBQ29980 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MICBQ29980 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MICBQ29980 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MICBQ29980 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MICBQ29980 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MICBQ29980 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MICBQ29980 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MICBQ29980 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MICBQ29980 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MICBQ29980 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MICBQ29980 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MICBQ29980 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MICBQ29980 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MICBQ29980 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MICBQ29980 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MICBQ29980 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MICBQ29980 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MICBQ29980 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MICBQ29980 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MICBQ29980 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MICBQ29980 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MICBQ29980 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MICBQ29980 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MICBQ29980 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MICBQ29980 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MICBQ29980 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MICBQ29980 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MICBQ29980 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MICBQ29980 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MICBQ29980 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MICBQ29980 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MICBQ29980 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MICBQ29980 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MICBQ29980 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MICBQ29980 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MICBQ29980 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MICBQ29980 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MICBQ29980 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MICBQ29980 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MICBQ29980 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MICBQ29980 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MICBQ29980 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MICBQ29980 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MICBQ29980 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MICBQ29980 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MICBQ29980 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MICBQ29980 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MICBQ29980 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MICBQ29980 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MICBQ29980 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MICBQ29980 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MICBQ29980 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MICBQ29980 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MICBQ29980 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MICBQ29980 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MICBQ29980 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MICBQ29980 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MICBQ29980 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MICBQ29980 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MICBQ29980 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MICBQ29980 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MICBQ29980 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MICBQ29980 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MICBQ29980 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MICBQ29980 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MICBQ29980 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MICBQ29980 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MICBQ29980 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MICBQ29980 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MICBQ29980 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MICBQ29980 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MICBQ29980 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MICBQ29980 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MICBQ29980 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MICBQ29980 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MICBQ29980 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MICBQ29980 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MICBQ29980 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MICBQ29980 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MICBQ29980 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MICBQ29980 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MICBQ29980 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MICBQ29980 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MICBQ29980 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MICBQ29980 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms