Protein–RNA interactions for Protein: Q1KMD3

HNRNPUL2, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPUL2Q1KMD3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
HNRNPUL2Q1KMD3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
HNRNPUL2Q1KMD3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC41.96■■■■■ 4.31
HNRNPUL2Q1KMD3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
HNRNPUL2Q1KMD3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
HNRNPUL2Q1KMD3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
HNRNPUL2Q1KMD3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
HNRNPUL2Q1KMD3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
HNRNPUL2Q1KMD3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
HNRNPUL2Q1KMD3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.93■■■■■ 4.3
HNRNPUL2Q1KMD3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
HNRNPUL2Q1KMD3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
HNRNPUL2Q1KMD3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
HNRNPUL2Q1KMD3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
HNRNPUL2Q1KMD3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
HNRNPUL2Q1KMD3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
HNRNPUL2Q1KMD3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
HNRNPUL2Q1KMD3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
HNRNPUL2Q1KMD3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
HNRNPUL2Q1KMD3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
HNRNPUL2Q1KMD3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
HNRNPUL2Q1KMD3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
HNRNPUL2Q1KMD3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC41.84■■■■■ 4.29
HNRNPUL2Q1KMD3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
HNRNPUL2Q1KMD3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
HNRNPUL2Q1KMD3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
HNRNPUL2Q1KMD3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
HNRNPUL2Q1KMD3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
HNRNPUL2Q1KMD3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
HNRNPUL2Q1KMD3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
HNRNPUL2Q1KMD3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
HNRNPUL2Q1KMD3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
HNRNPUL2Q1KMD3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
HNRNPUL2Q1KMD3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
HNRNPUL2Q1KMD3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC41.82■■■■■ 4.29
HNRNPUL2Q1KMD3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
HNRNPUL2Q1KMD3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
HNRNPUL2Q1KMD3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
HNRNPUL2Q1KMD3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC41.79■■■■■ 4.28
HNRNPUL2Q1KMD3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
HNRNPUL2Q1KMD3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC41.78■■■■■ 4.28
HNRNPUL2Q1KMD3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
HNRNPUL2Q1KMD3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
HNRNPUL2Q1KMD3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
HNRNPUL2Q1KMD3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.28
HNRNPUL2Q1KMD3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
HNRNPUL2Q1KMD3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
HNRNPUL2Q1KMD3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
HNRNPUL2Q1KMD3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC41.72■■■■■ 4.27
HNRNPUL2Q1KMD3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
HNRNPUL2Q1KMD3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
HNRNPUL2Q1KMD3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
HNRNPUL2Q1KMD3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
HNRNPUL2Q1KMD3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.68■■■■■ 4.26
HNRNPUL2Q1KMD3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
HNRNPUL2Q1KMD3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
HNRNPUL2Q1KMD3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
HNRNPUL2Q1KMD3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
HNRNPUL2Q1KMD3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
HNRNPUL2Q1KMD3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
HNRNPUL2Q1KMD3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
HNRNPUL2Q1KMD3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
HNRNPUL2Q1KMD3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
HNRNPUL2Q1KMD3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC41.62■■■■■ 4.25
HNRNPUL2Q1KMD3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
HNRNPUL2Q1KMD3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
HNRNPUL2Q1KMD3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
HNRNPUL2Q1KMD3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC41.6■■■■■ 4.25
HNRNPUL2Q1KMD3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
HNRNPUL2Q1KMD3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
HNRNPUL2Q1KMD3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
HNRNPUL2Q1KMD3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC41.59■■■■■ 4.25
HNRNPUL2Q1KMD3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
HNRNPUL2Q1KMD3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
HNRNPUL2Q1KMD3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
HNRNPUL2Q1KMD3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
HNRNPUL2Q1KMD3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
HNRNPUL2Q1KMD3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.25
HNRNPUL2Q1KMD3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC41.57■■■■■ 4.24
HNRNPUL2Q1KMD3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
HNRNPUL2Q1KMD3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC41.55■■■■■ 4.24
HNRNPUL2Q1KMD3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
HNRNPUL2Q1KMD3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
HNRNPUL2Q1KMD3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
HNRNPUL2Q1KMD3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
HNRNPUL2Q1KMD3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
HNRNPUL2Q1KMD3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
HNRNPUL2Q1KMD3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
HNRNPUL2Q1KMD3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
HNRNPUL2Q1KMD3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
HNRNPUL2Q1KMD3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
HNRNPUL2Q1KMD3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
HNRNPUL2Q1KMD3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
HNRNPUL2Q1KMD3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
HNRNPUL2Q1KMD3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
HNRNPUL2Q1KMD3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
HNRNPUL2Q1KMD3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
HNRNPUL2Q1KMD3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
HNRNPUL2Q1KMD3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
HNRNPUL2Q1KMD3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms