Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ME3Q16798 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ME3Q16798 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ME3Q16798 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ME3Q16798 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ME3Q16798 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ME3Q16798 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ME3Q16798 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ME3Q16798 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ME3Q16798 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ME3Q16798 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ME3Q16798 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ME3Q16798 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ME3Q16798 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ME3Q16798 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ME3Q16798 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ME3Q16798 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ME3Q16798 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ME3Q16798 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ME3Q16798 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ME3Q16798 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
ME3Q16798 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ME3Q16798 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ME3Q16798 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ME3Q16798 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ME3Q16798 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ME3Q16798 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ME3Q16798 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ME3Q16798 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ME3Q16798 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ME3Q16798 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ME3Q16798 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ME3Q16798 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ME3Q16798 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ME3Q16798 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ME3Q16798 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ME3Q16798 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ME3Q16798 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ME3Q16798 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ME3Q16798 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ME3Q16798 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ME3Q16798 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ME3Q16798 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ME3Q16798 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ME3Q16798 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ME3Q16798 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ME3Q16798 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ME3Q16798 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ME3Q16798 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ME3Q16798 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ME3Q16798 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ME3Q16798 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ME3Q16798 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ME3Q16798 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ME3Q16798 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ME3Q16798 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ME3Q16798 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ME3Q16798 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ME3Q16798 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ME3Q16798 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
ME3Q16798 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ME3Q16798 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ME3Q16798 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ME3Q16798 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ME3Q16798 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ME3Q16798 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ME3Q16798 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
ME3Q16798 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ME3Q16798 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ME3Q16798 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ME3Q16798 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ME3Q16798 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ME3Q16798 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ME3Q16798 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ME3Q16798 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ME3Q16798 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ME3Q16798 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
ME3Q16798 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ME3Q16798 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ME3Q16798 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ME3Q16798 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ME3Q16798 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ME3Q16798 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ME3Q16798 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ME3Q16798 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ME3Q16798 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ME3Q16798 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ME3Q16798 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ME3Q16798 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ME3Q16798 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ME3Q16798 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ME3Q16798 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ME3Q16798 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ME3Q16798 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ME3Q16798 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.49
ME3Q16798 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ME3Q16798 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
ME3Q16798 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ME3Q16798 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ME3Q16798 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
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