Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLPPQ16740 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLPPQ16740 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CLPPQ16740 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLPPQ16740 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLPPQ16740 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLPPQ16740 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLPPQ16740 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLPPQ16740 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CLPPQ16740 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CLPPQ16740 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CLPPQ16740 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CLPPQ16740 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CLPPQ16740 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLPPQ16740 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLPPQ16740 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLPPQ16740 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLPPQ16740 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLPPQ16740 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLPPQ16740 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CLPPQ16740 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLPPQ16740 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLPPQ16740 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLPPQ16740 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLPPQ16740 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLPPQ16740 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLPPQ16740 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLPPQ16740 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLPPQ16740 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLPPQ16740 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLPPQ16740 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
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