Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRR4Q16378 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRR4Q16378 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRR4Q16378 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRR4Q16378 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PRR4Q16378 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PRR4Q16378 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRR4Q16378 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRR4Q16378 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRR4Q16378 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRR4Q16378 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PRR4Q16378 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRR4Q16378 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PRR4Q16378 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRR4Q16378 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRR4Q16378 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRR4Q16378 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRR4Q16378 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRR4Q16378 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRR4Q16378 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRR4Q16378 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRR4Q16378 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRR4Q16378 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRR4Q16378 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRR4Q16378 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRR4Q16378 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRR4Q16378 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRR4Q16378 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRR4Q16378 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRR4Q16378 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRR4Q16378 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRR4Q16378 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRR4Q16378 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRR4Q16378 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRR4Q16378 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRR4Q16378 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRR4Q16378 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR4Q16378 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR4Q16378 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR4Q16378 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR4Q16378 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR4Q16378 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR4Q16378 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR4Q16378 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR4Q16378 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR4Q16378 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR4Q16378 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRR4Q16378 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRR4Q16378 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRR4Q16378 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRR4Q16378 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRR4Q16378 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRR4Q16378 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRR4Q16378 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRR4Q16378 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRR4Q16378 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRR4Q16378 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRR4Q16378 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRR4Q16378 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRR4Q16378 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRR4Q16378 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRR4Q16378 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRR4Q16378 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRR4Q16378 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRR4Q16378 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRR4Q16378 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRR4Q16378 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRR4Q16378 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRR4Q16378 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRR4Q16378 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRR4Q16378 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRR4Q16378 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRR4Q16378 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRR4Q16378 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRR4Q16378 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRR4Q16378 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRR4Q16378 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRR4Q16378 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRR4Q16378 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRR4Q16378 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRR4Q16378 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRR4Q16378 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRR4Q16378 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRR4Q16378 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRR4Q16378 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRR4Q16378 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRR4Q16378 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRR4Q16378 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRR4Q16378 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRR4Q16378 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRR4Q16378 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRR4Q16378 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRR4Q16378 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRR4Q16378 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRR4Q16378 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRR4Q16378 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRR4Q16378 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRR4Q16378 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRR4Q16378 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRR4Q16378 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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