Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NTRK3Q16288 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NTRK3Q16288 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NTRK3Q16288 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NTRK3Q16288 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
NTRK3Q16288 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NTRK3Q16288 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NTRK3Q16288 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
NTRK3Q16288 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NTRK3Q16288 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NTRK3Q16288 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NTRK3Q16288 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NTRK3Q16288 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NTRK3Q16288 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NTRK3Q16288 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NTRK3Q16288 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NTRK3Q16288 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NTRK3Q16288 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NTRK3Q16288 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NTRK3Q16288 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NTRK3Q16288 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NTRK3Q16288 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NTRK3Q16288 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NTRK3Q16288 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NTRK3Q16288 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NTRK3Q16288 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NTRK3Q16288 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NTRK3Q16288 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
NTRK3Q16288 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NTRK3Q16288 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NTRK3Q16288 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NTRK3Q16288 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NTRK3Q16288 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NTRK3Q16288 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
NTRK3Q16288 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NTRK3Q16288 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NTRK3Q16288 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NTRK3Q16288 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NTRK3Q16288 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
NTRK3Q16288 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NTRK3Q16288 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
NTRK3Q16288 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NTRK3Q16288 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NTRK3Q16288 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NTRK3Q16288 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NTRK3Q16288 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
NTRK3Q16288 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NTRK3Q16288 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NTRK3Q16288 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NTRK3Q16288 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NTRK3Q16288 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NTRK3Q16288 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NTRK3Q16288 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NTRK3Q16288 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NTRK3Q16288 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NTRK3Q16288 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NTRK3Q16288 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NTRK3Q16288 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
NTRK3Q16288 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NTRK3Q16288 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NTRK3Q16288 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NTRK3Q16288 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NTRK3Q16288 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NTRK3Q16288 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NTRK3Q16288 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NTRK3Q16288 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NTRK3Q16288 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NTRK3Q16288 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
NTRK3Q16288 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NTRK3Q16288 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NTRK3Q16288 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NTRK3Q16288 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NTRK3Q16288 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NTRK3Q16288 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NTRK3Q16288 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NTRK3Q16288 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NTRK3Q16288 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NTRK3Q16288 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NTRK3Q16288 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NTRK3Q16288 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NTRK3Q16288 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NTRK3Q16288 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
NTRK3Q16288 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NTRK3Q16288 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NTRK3Q16288 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NTRK3Q16288 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NTRK3Q16288 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NTRK3Q16288 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
NTRK3Q16288 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NTRK3Q16288 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NTRK3Q16288 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NTRK3Q16288 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
NTRK3Q16288 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NTRK3Q16288 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NTRK3Q16288 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NTRK3Q16288 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NTRK3Q16288 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NTRK3Q16288 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NTRK3Q16288 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
NTRK3Q16288 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
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