Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFHX3Q15911 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZFHX3Q15911 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZFHX3Q15911 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZFHX3Q15911 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZFHX3Q15911 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZFHX3Q15911 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZFHX3Q15911 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZFHX3Q15911 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZFHX3Q15911 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZFHX3Q15911 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZFHX3Q15911 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZFHX3Q15911 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZFHX3Q15911 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZFHX3Q15911 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZFHX3Q15911 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZFHX3Q15911 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZFHX3Q15911 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZFHX3Q15911 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFHX3Q15911 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFHX3Q15911 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFHX3Q15911 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFHX3Q15911 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZFHX3Q15911 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZFHX3Q15911 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZFHX3Q15911 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZFHX3Q15911 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFHX3Q15911 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFHX3Q15911 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZFHX3Q15911 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZFHX3Q15911 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZFHX3Q15911 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZFHX3Q15911 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZFHX3Q15911 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFHX3Q15911 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFHX3Q15911 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFHX3Q15911 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFHX3Q15911 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFHX3Q15911 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFHX3Q15911 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFHX3Q15911 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZFHX3Q15911 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFHX3Q15911 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFHX3Q15911 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFHX3Q15911 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFHX3Q15911 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFHX3Q15911 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFHX3Q15911 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFHX3Q15911 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFHX3Q15911 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFHX3Q15911 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFHX3Q15911 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFHX3Q15911 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFHX3Q15911 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFHX3Q15911 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFHX3Q15911 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFHX3Q15911 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFHX3Q15911 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFHX3Q15911 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFHX3Q15911 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFHX3Q15911 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFHX3Q15911 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFHX3Q15911 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZFHX3Q15911 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ZFHX3Q15911 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZFHX3Q15911 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZFHX3Q15911 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZFHX3Q15911 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZFHX3Q15911 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZFHX3Q15911 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZFHX3Q15911 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZFHX3Q15911 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZFHX3Q15911 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZFHX3Q15911 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZFHX3Q15911 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZFHX3Q15911 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZFHX3Q15911 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZFHX3Q15911 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZFHX3Q15911 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZFHX3Q15911 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZFHX3Q15911 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZFHX3Q15911 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZFHX3Q15911 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZFHX3Q15911 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZFHX3Q15911 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZFHX3Q15911 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZFHX3Q15911 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZFHX3Q15911 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
ZFHX3Q15911 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZFHX3Q15911 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZFHX3Q15911 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZFHX3Q15911 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZFHX3Q15911 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZFHX3Q15911 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZFHX3Q15911 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZFHX3Q15911 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZFHX3Q15911 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZFHX3Q15911 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZFHX3Q15911 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZFHX3Q15911 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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