Protein–RNA interactions for Protein: Q15835

GRK1, Rhodopsin kinase, humanhuman

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRK1Q15835 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRK1Q15835 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRK1Q15835 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRK1Q15835 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRK1Q15835 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRK1Q15835 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRK1Q15835 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRK1Q15835 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GRK1Q15835 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRK1Q15835 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRK1Q15835 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRK1Q15835 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRK1Q15835 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRK1Q15835 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRK1Q15835 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRK1Q15835 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRK1Q15835 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GRK1Q15835 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRK1Q15835 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRK1Q15835 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRK1Q15835 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRK1Q15835 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRK1Q15835 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRK1Q15835 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GRK1Q15835 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRK1Q15835 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRK1Q15835 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRK1Q15835 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRK1Q15835 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRK1Q15835 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRK1Q15835 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRK1Q15835 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRK1Q15835 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRK1Q15835 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRK1Q15835 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRK1Q15835 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRK1Q15835 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRK1Q15835 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GRK1Q15835 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRK1Q15835 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRK1Q15835 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRK1Q15835 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRK1Q15835 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRK1Q15835 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRK1Q15835 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRK1Q15835 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRK1Q15835 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRK1Q15835 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GRK1Q15835 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRK1Q15835 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRK1Q15835 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRK1Q15835 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRK1Q15835 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRK1Q15835 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRK1Q15835 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRK1Q15835 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRK1Q15835 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GRK1Q15835 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRK1Q15835 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRK1Q15835 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRK1Q15835 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRK1Q15835 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRK1Q15835 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRK1Q15835 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRK1Q15835 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRK1Q15835 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRK1Q15835 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRK1Q15835 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRK1Q15835 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRK1Q15835 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRK1Q15835 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRK1Q15835 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRK1Q15835 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRK1Q15835 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRK1Q15835 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRK1Q15835 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRK1Q15835 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRK1Q15835 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRK1Q15835 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRK1Q15835 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRK1Q15835 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRK1Q15835 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRK1Q15835 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRK1Q15835 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRK1Q15835 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRK1Q15835 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRK1Q15835 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRK1Q15835 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRK1Q15835 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRK1Q15835 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRK1Q15835 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRK1Q15835 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRK1Q15835 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRK1Q15835 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRK1Q15835 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRK1Q15835 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRK1Q15835 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GRK1Q15835 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRK1Q15835 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRK1Q15835 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
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