Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TWIST1Q15672 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TWIST1Q15672 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TWIST1Q15672 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TWIST1Q15672 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TWIST1Q15672 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TWIST1Q15672 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWIST1Q15672 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWIST1Q15672 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWIST1Q15672 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWIST1Q15672 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWIST1Q15672 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWIST1Q15672 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWIST1Q15672 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWIST1Q15672 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWIST1Q15672 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWIST1Q15672 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWIST1Q15672 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TWIST1Q15672 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TWIST1Q15672 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TWIST1Q15672 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TWIST1Q15672 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWIST1Q15672 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWIST1Q15672 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWIST1Q15672 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWIST1Q15672 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWIST1Q15672 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWIST1Q15672 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWIST1Q15672 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWIST1Q15672 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWIST1Q15672 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWIST1Q15672 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TWIST1Q15672 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWIST1Q15672 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWIST1Q15672 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWIST1Q15672 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWIST1Q15672 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TWIST1Q15672 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWIST1Q15672 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWIST1Q15672 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWIST1Q15672 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWIST1Q15672 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWIST1Q15672 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TWIST1Q15672 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TWIST1Q15672 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TWIST1Q15672 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TWIST1Q15672 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TWIST1Q15672 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TWIST1Q15672 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TWIST1Q15672 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TWIST1Q15672 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TWIST1Q15672 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TWIST1Q15672 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TWIST1Q15672 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TWIST1Q15672 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TWIST1Q15672 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TWIST1Q15672 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TWIST1Q15672 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TWIST1Q15672 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TWIST1Q15672 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TWIST1Q15672 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWIST1Q15672 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWIST1Q15672 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWIST1Q15672 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TWIST1Q15672 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TWIST1Q15672 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms